RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 COPRSQ9NQ92 184 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 SNAPC2Q13487 334 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 USP40Q9NVE5 1235 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 TCP10Q12799 353 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 MEIS3Q99687 375 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 PRDX5P30044 214 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF22Q14807 665 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 SLF2Q8IX21 1173 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 LAMB1P07942 1786 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 IRF6O14896 467 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 SRGAP3O43295 1099 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 PHKA1P46020 1223 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 PPATQ06203 517 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 PPIL2Q13356 520 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC102BQ68D86 513 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 OTOFQ9HC10 1997 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 TIMM10P62072 90 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF11Q86T75 865 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCF2Q9UG63 623 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 BTBD19C9JJ37 291 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 TLR2O60603 784 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC34A2O95436 690 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 ADORA1P30542 326 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 INPP5BP32019 993 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 NFIAQ12857 509 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 GORABQ5T7V8 394 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1B0GUL7 405 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB22O15209 634 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 TFCP2Q12800 502 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 XAGE2Q96GT9 111 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 AK9Q5TCS8 1911 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 GNAI2P04899 355 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 ENTPD3O75355 529 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 MTX1Q13505 466 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 ARMC5Q96C12 935 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 GNRH1P01148 92 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 RASGRF1Q13972 1273 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 IDI2Q9BXS1 227 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 POTEFA5A3E0 1075 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 RGS3P49796 1198 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 PICK1Q9NRD5 415 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 PDHXO00330 501 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM27P14373 513 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 CXCL11O14625 94 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 BCAR3O75815 825 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 LDHCP07864 332 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 BTDP43251 543 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 PRMT2P55345 433 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 GSTO1P78417 241 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 GAKO14976 1311 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 HOXD10P28358 340 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 CAP1Q01518 475 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 PICALMQ13492 652 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 C17orf99Q6UX52 265 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF333Q96JL9 665 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 CPA4Q9UI42 421 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.75■■□□□ 1.39
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