RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 CUL4AQ13619 759 aa31.78■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 AOC3Q16853 763 aa31.78■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa31.78■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 ECE2O60344 883 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 GIMAP6Q6P9H5 292 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 PSMD1Q99460 953 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 TRDNQ13061 729 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 KLHL34Q8N239 644 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 NCOA7Q8NI08 942 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 NBPF3Q9H094 633 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 LAMA4Q16363 1823 aa31.76■■■□□ 2.68
HOXB3-210ENST00000489475 PPIP5K2O43314 1243 aa31.76■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 PTGER2P43116 358 aa31.76■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 CERS3Q8IU89 383 aa31.76■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 FGD1P98174 961 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 TBC1D10CQ8IV04 446 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 CHMP5Q9NZZ3 219 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 PPP4CP60510 307 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 DDIT3P35638 169 aa31.74■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 Q6ZUG5 572 aa31.74■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 MYH2Q9UKX2 1941 aa31.74■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 STRIP1Q5VSL9 837 aa31.73■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 CERS5Q8N5B7 392 aa31.73■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 MCM5P33992 734 aa31.72■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 TPCN1Q9ULQ1 816 aa31.72■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa31.71■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 CTDSPL2Q05D32 466 aa31.71■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 KCNQ5Q9NR82 932 aa31.71■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 USP17L3A6NCW0 530 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 USP17L4A6NCW7 530 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 BTDP43251 543 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 PPARAQ07869 468 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 AKNAD1Q5T1N1 836 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 USP17L1Q7RTZ2 530 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC2Q9BYS8 371 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
HOXB3-210ENST00000489475 GAKO14976 1311 aa31.7■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 MINDY4BA8MYZ0 360 aa31.7■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 PLCG2P16885 1265 aa31.7■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 MXD3Q9BW11 206 aa31.7■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 VPS33BQ9H267 617 aa31.7■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 CNNM2Q9H8M5 875 aa31.7■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 MFSD6Q6ZSS7 791 aa31.69■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 ANAPC4Q9UJX5 808 aa31.69■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 F8W031 263 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 USP5P45974 858 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 ME3Q16798 604 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 CHST3Q7LGC8 479 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 STAG1Q8WVM7 1258 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 BRF1Q92994 677 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 WDR19Q8NEZ3 1342 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 PRC1O43663 620 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 LARGE1O95461 756 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 AGXT2Q9BYV1 514 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 TIAM2Q8IVF5 1701 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 DACT2Q5SW24 774 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 CTR9Q6PD62 1173 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 LARGE2Q8N3Y3 721 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 KRT23Q9C075 422 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 NEDD4P46934 1319 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 USP17L12C9JPN9 530 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 USP17L21D6R901 530 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 FBXL16Q8N461 479 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 SPON1Q9HCB6 807 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 SCN9AQ15858 1988 aa31.65■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 B4E1Z4 1266 aa31.65■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC83Q8IWF9 413 aa31.64■■■□□ 2.66
HOXB3-210ENST00000489475 ANTXR2P58335 489 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 SBK1Q52WX2 424 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 INCENPQ9NQS7 918 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 TOMM22Q9NS69 142 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 MCM9Q9NXL9 1143 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 HHIPL2Q6UWX4 724 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 TEX11Q8IYF3 940 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 TEKT1Q969V4 418 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 BCS1LQ9Y276 419 aa31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms