RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT85P78386 507 aa25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX11Q96FC9 970 aa25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.26■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.26■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 PRKAB2O43741 272 aa25.26■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.26■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.26■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 NEDD4P46934 1319 aa25.26■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 FIBPO43427 364 aa25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 ELP1O95163 1332 aa25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 TMC4Q7Z404 712 aa25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 FERMT3Q86UX7 667 aa25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 STAG1Q8WVM7 1258 aa25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 B4E1Z4 1266 aa25.24■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 H3BQV1 296 aa25.24■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 TDO2P48775 406 aa25.24■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 RESTQ13127 1097 aa25.24■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 IFFO2Q5TF58 517 aa25.24■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT23Q9C075 422 aa25.24■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP2B4P23634 1241 aa25.24■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.24■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 MTA3Q9BTC8 594 aa25.24■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.23■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.23■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa25.23■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF384Q8TF68 577 aa25.23■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.23■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 ANAPC4Q9UJX5 808 aa25.23■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 GPSM2P81274 684 aa25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 RGS22Q8NE09 1264 aa25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 LIFRP42702 1097 aa25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.22■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 MECOMQ03112 1051 aa25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 KLHL34Q8N239 644 aa25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 GGA1Q9UJY5 639 aa25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 LAMB1P07942 1786 aa25.21■■□□□ 1.63
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.2■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 TTC6Q86TZ1 520 aa25.2■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.2■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 UFL1O94874 794 aa25.19■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 PPARAQ07869 468 aa25.19■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.19■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 PANK2Q9BZ23 570 aa25.19■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 LY9Q9HBG7 655 aa25.19■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 SYCE3A1L190 88 aa25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 APOA5Q6Q788 366 aa25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC51AQ86UW1 340 aa25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 LTBP1Q14766 1721 aa25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 KDM4AO75164 1064 aa25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 PRDX5P30044 214 aa25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.18■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.17■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 SP8Q8IXZ3 490 aa25.17■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 INCENPQ9NQS7 918 aa25.17■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.17■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 NID2Q14112 1375 aa25.17■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.17■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 CPLX1O14810 134 aa25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 ATL3Q6DD88 541 aa25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 POTEAQ6S8J7 498 aa25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 CFAP45Q9UL16 551 aa25.16■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 MMP10P09238 476 aa25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 PCP11498 1178 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
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