RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRE-201ENST00000254667 CTAGE9A4FU28 777 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRE-201ENST00000254667 MYL5Q02045 173 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRE-201ENST00000254667 TCIRG1Q13488 830 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRE-201ENST00000254667 LETM2Q2VYF4 491 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRE-201ENST00000254667 SPATA5Q8NB90 893 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRE-201ENST00000254667 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PTPRE-201ENST00000254667 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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PTPRE-201ENST00000254667 ANO1Q5XXA6 986 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRE-201ENST00000254667 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRE-201ENST00000254667 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRE-201ENST00000254667 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRE-201ENST00000254667 H0YIN7 160 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRE-201ENST00000254667 ATP5JP18859 108 aa21.38■■□□□ 1.01
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PTPRE-201ENST00000254667 LMAN1P49257 510 aa21.38■■□□□ 1.01
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PTPRE-201ENST00000254667 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.38■■□□□ 1.01
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PTPRE-201ENST00000254667 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRE-201ENST00000254667 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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PTPRE-201ENST00000254667 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.37■■□□□ 1.01
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PTPRE-201ENST00000254667 CPA1P15085 419 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRE-201ENST00000254667 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.36■■□□□ 1.01
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PTPRE-201ENST00000254667 SEC24BO95487 1268 aa21.36■■□□□ 1.01
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PTPRE-201ENST00000254667 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
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PTPRE-201ENST00000254667 ATP2A1O14983 1001 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRE-201ENST00000254667 USP21Q9UK80 565 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRE-201ENST00000254667 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRE-201ENST00000254667 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.33■■□□□ 1.01
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PTPRE-201ENST00000254667 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
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PTPRE-201ENST00000254667 ZAP70P43403 619 aa21.33■■□□□ 1
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PTPRE-201ENST00000254667 TUBBP07437 444 aa21.32■■□□□ 1
PTPRE-201ENST00000254667 HSPA4P34932 840 aa21.32■■□□□ 1
PTPRE-201ENST00000254667 VWA3BQ502W6 1294 aa21.32■■□□□ 1
PTPRE-201ENST00000254667 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PTPRE-201ENST00000254667 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.32■■□□□ 1
PTPRE-201ENST00000254667 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.32■■□□□ 1
PTPRE-201ENST00000254667 CLCN1P35523 988 aa21.32■■□□□ 1
PTPRE-201ENST00000254667 SMTNP53814 917 aa21.32■■□□□ 1
PTPRE-201ENST00000254667 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
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