RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 CACNB3P54284 484 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP3K12Q12852 859 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 LDHCP07864 332 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 BTDP43251 543 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 MAGEB6Q8N7X4 407 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 HSPA6P17066 643 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 APLP1P51693 650 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 CDCA5Q96FF9 252 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC25A39-201ENST00000225308 RFX7Q2KHR2 1363 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 PDE6AP16499 860 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 PDE4AP27815 886 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 RHBDL3P58872 404 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 TNFAIP1Q13829 316 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 CST9Q5W186 159 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 USP40Q9NVE5 1235 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 FOCADQ5VW36 1801 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 CNTNAP1P78357 1384 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP7A1P22680 504 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 NFIAQ12857 509 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 RASA3Q14644 834 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 PCNTO95613 3336 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 AK9Q5TCS8 1911 aa26.36■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa26.36■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 CELF2O95319 508 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.36■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.811e-6■■□□□ 14.1
SLC25A39-201ENST00000225308 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 CHGBP05060 677 aa26.36■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP4CP60510 307 aa26.36■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM83AQ86UY5 434 aa26.36■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF532Q9HCE3 1301 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 ADD2P35612 726 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 TEPSINQ96N21 525 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.816e-8■■■□□ 16
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.34■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 TNNI2P48788 182 aa26.34■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.34■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 MIGA1Q8NAN2 632 aa26.34■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 IDI2Q9BXS1 227 aa26.34■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 BAG3O95817 575 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 CREBZFQ9NS37 354 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC25A39-201ENST00000225308 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 HTRA3P83110 453 aa26.32■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 TCP10Q12799 353 aa26.32■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 PLCG2P16885 1265 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 RGS3P49796 1198 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 UBE3CQ15386 1083 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM151AQ8WW52 585 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 ZFPM1Q8IX07 1006 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 TEX11Q8IYF3 940 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.29■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.29■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 ENTPD3O75355 529 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 NPM3O75607 178 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 PICALMQ13492 652 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 CERS3Q8IU89 383 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 EVI5LQ96CN4 794 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 FSD1Q9BTV5 496 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 MYH1P12882 1939 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 NF2P35240 595 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 SAPCD2Q86UD0 394 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 FZD1Q9UP38 647 aa26.26■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 TLL2Q9Y6L7 1015 aa26.26■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
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