RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 MLST8Q9BVC4 326 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 MYO18BQ8IUG5 2567 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A0J9YW62 118 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 OOSP1A8MZH6 123 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 CHEK1O14757 476 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 LMX1BO60663 402 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 MPDU1O75352 247 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 CD3EP07766 207 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 PSMB2P49721 201 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 CENPWQ5EE01 88 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF138Q8WVD3 245 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 NXPH3O95157 252 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 TRACP01848 142 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 IAPPP10997 89 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 CD59P13987 128 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 CD40P25942 277 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 HBBP68871 147 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 SRYQ05066 204 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 PRRG4Q9BZD6 226 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 JPT2Q9H910 190 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1W2PRX2 142 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 J3QL48 77 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 RRHO14718 337 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 IGLV3-27P01718 113 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 FXYD3Q14802 87 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 C4orf26Q17RF5 130 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 C1orf195Q5TG92 126 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 TREML4Q6UXN2 200 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 OR5AS1Q8N127 324 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 RPRMLQ8N4K4 120 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 C16orf92Q96LL3 132 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 C15orf62A8K5M9 175 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC01619G3V211 115 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 WISP1O95388 367 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 CRYGAP11844 174 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 CST6Q15828 149 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEFF1Q8IYR6 380 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 ABCA7Q8IZY2 2146 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 RAB42Q8N4Z0 105 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 C3orf56Q8N813 242 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM57AQ8TBR7 257 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 DPH3Q96FX2 82 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 ATG2BQ96BY7 2078 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 CEP192Q8TEP8 1941 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 APC2O95996 2303 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A0U1RRA0 63 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 DPM2O94777 84 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 ARL14EPLP0DKL9 152 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 GCHFRP30047 84 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 SPINT3P49223 89 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 TNP2Q05952 138 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 KLRB1Q12918 225 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 KISS1Q15726 138 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 PCP2Q8IVA1 136 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM86BQ8N661 226 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-208ENST00000471759 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.34□□□□□ -1.56
RABGGTB-208ENST00000471759 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-208ENST00000471759 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-208ENST00000471759 ACTL6BO94805 426 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHMP01871 453 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-208ENST00000471759 IFI6P09912 130 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-208ENST00000471759 Q6ZQT7 251 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-208ENST00000471759 PDPNQ86YL7 162 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-208ENST00000471759 AMN1Q8IY45 258 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-208ENST00000471759 RND1Q92730 232 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-208ENST00000471759 CYYR1Q96J86 154 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-208ENST00000471759 SPACA5Q96QH8 159 aa5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.5 ms