RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 BATFQ16520 125 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM183BQ1AE95 376 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 WNK2Q9Y3S1 2297 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 OR2D3Q8NGH3 330 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 RBP4P02753 201 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 ETFRF1Q6IPR1 90 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 LCN12Q6JVE5 192 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 MUC15Q8N387 334 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM116Q8NCL8 245 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 RPEQ96AT9 228 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 TRGV9Q99603 122 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 CLEC7AQ9BXN2 247 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 ONECUT1Q9UBC0 465 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 GP9P14770 177 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 RAB4AP20338 218 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 PRRX1P54821 245 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 Q9H3A6 140 aa20.34■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 C3orf79P0CE67 100 aa20.33■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 SSTP61278 116 aa20.33■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 C22orf15Q8WYQ4 148 aa20.33■□□□□ 0.85
RAB40C-201ENST00000248139 B9A039 149 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 M0QZ24 198 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 CDSNQ15517 529 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 FAM231DQ6ZW35 169 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 HILPDAQ9Y5L2 63 aa20.33■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 MAJINQ3KP22 176 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 FBLN7Q53RD9 439 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 MIEN1Q9BRT3 115 aa20.32■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 CASP6P55212 293 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 GPR82Q96P67 336 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 ZFHX3Q15911 3703 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 C17orf77Q96MU5 243 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 C20orf144Q9BQM9 153 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 PGLYRP4Q96LB8 373 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 CACNA1BQ00975 2339 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 CNIH1O95406 144 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 ARF6P62330 175 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 C8orf46Q8TAG6 207 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 GTSF1Q8WW33 167 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 AKAP6Q13023 2319 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 TIMM23O14925 209 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 IGLC1P0CG04 106 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 PMCHL1Q16048 86 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 TCRAP04437 139 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 COX19Q49B96 90 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 MLST8Q9BVC4 326 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 KLRD1Q13241 179 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 PVRIGQ6DKI7 326 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 STXBP6Q8NFX7 210 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 HIGD1AQ9Y241 93 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 MMDQ15546 238 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 SPATA45Q537H7 98 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 KLF12Q9Y4X4 402 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RAB40C-201ENST00000248139 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa20.27■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 PRNTQ86SH4 94 aa20.27■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 C5orf17Q8NAS9 161 aa20.27■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 VKORC1Q9BQB6 163 aa20.27■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 I3L2K1 104 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 HSBP1O75506 76 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 IGKV1-17P01599 117 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 NBL1P41271 181 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 RASL11BQ9BPW5 248 aa20.26■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 P01737 135 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 RBPJQ06330 500 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 TNFRSF14Q92956 283 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 BORCS7Q96B45 105 aa20.25■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 K7ENP7 123 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 TOMM40O96008 361 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 LTAP01374 205 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 TFPI2P48307 235 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 EBLN2Q6P2I7 272 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 CLEC5AQ9NY25 188 aa20.24■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 M0R2Z0 102 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 SSX8Q7RTT4 187 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 A0A1B0GXF2 115 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 CTRLP40313 264 aa20.22■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 Q56UQ5 140 aa20.22■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 LY6LH3BQJ8 138 aa20.22■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 PRSS22Q9GZN4 317 aa20.22■□□□□ 0.83
RAB40C-201ENST00000248139 C19orf71A6NCJ1 209 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms