RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 P0C879 139 aa11.6□□□□□ -0.55
SPCS1-201ENST00000233025 MFAP4P55083 255 aa11.6□□□□□ -0.55
SPCS1-201ENST00000233025 H2BFSP57053 126 aa11.6□□□□□ -0.55
SPCS1-201ENST00000233025 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SPCS1-201ENST00000233025 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa11.6□□□□□ -0.55
SPCS1-201ENST00000233025 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa11.6□□□□□ -0.55
SPCS1-201ENST00000233025 LGI3Q8N145 548 aa11.6□□□□□ -0.55
SPCS1-201ENST00000233025 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.6□□□□□ -0.55
SPCS1-201ENST00000233025 B3GALNT1O75752 331 aa11.59□□□□□ -0.55
SPCS1-201ENST00000233025 PAFAH1B2P68402 229 aa11.59□□□□□ -0.55
SPCS1-201ENST00000233025 TCF24Q7RTU0 167 aa11.59□□□□□ -0.55
SPCS1-201ENST00000233025 THAP6Q8TBB0 222 aa11.59□□□□□ -0.55
SPCS1-201ENST00000233025 TXN2Q99757 166 aa11.59□□□□□ -0.55
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 L7N2F9 121 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV1-5P01602 117 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 SPINK9Q5DT21 86 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM88Q6PEY1 159 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf62Q8N4C0 152 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 OR4A16Q8NH70 328 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 NMES1Q9C002 83 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.58□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 HMSDA8MTL9 139 aa11.57□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 YIF1AO95070 293 aa11.57□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 HOXB5P09067 269 aa11.57□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 OR5AC1P0C628 307 aa11.57□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PET100P0DJ07 73 aa11.57□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 BTF3P20290 206 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 OR11H4Q8NGC9 324 aa11.57□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf50Q96LR7 162 aa11.57□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TP53RKQ96S44 253 aa11.57□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 VSIRQ9H7M9 311 aa11.57□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 MDFICQ9P1T7 246 aa11.57□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.56□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 GNG7O60262 68 aa11.56□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TSC22D2O75157 780 aa11.56□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TOMM20LQ6UXN7 152 aa11.56□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 LILRB2Q8N423 598 aa11.56□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 LRTM2Q8N967 370 aa11.56□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ST8SIA2Q92186 375 aa11.56□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 KNCNA6PVL3 124 aa11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ADAP1O75689 374 aa11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 APOHP02749 345 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 RLN2P04090 185 aa11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 CD5P06127 495 aa11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A4P12235 298 aa11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ERHP84090 104 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 SMCO1Q147U7 214 aa11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 SP6Q3SY56 376 aa11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF546Q86UE3 836 aa11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM222Q9H0R3 208 aa11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PRR13Q9NZ81 148 aa11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0G2JRQ6 117 aa11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ARPC5O15511 151 aa11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ST8SIA3O43173 380 aa11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 Q5BKY6 102 aa11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF600Q6ZNG1 722 aa11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 IL22RA2Q969J5 263 aa11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 GINS3Q9BRX5 216 aa11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ATG101Q9BSB4 218 aa11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 DKK2Q9UBU2 259 aa11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP11.54□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0D9SG52 128 aa11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GU03 582 aa11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 G3V3Q6 166 aa11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 RGS13O14921 159 aa11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 HTN3P15516 51 aa11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 NPBWR1P48145 328 aa11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 AKR1C2P52895 323 aa11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM268Q5VZI3 342 aa11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35G3Q8N808 338 aa11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 GLYATL2Q8WU03 294 aa11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF503Q96F45 646 aa11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.52□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 MPC2O95563 127 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms