RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 NOTCH1P46531 2555 aa9.6□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 LGALS9O00182 355 aa9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 AGPAT2O15120 278 aa9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 FGF7P21781 194 aa9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 PRR20EP86478 221 aa9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 PRR20CP86479 221 aa9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 PRR20DP86480 221 aa9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 PRR20BP86481 221 aa9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 PRR20AP86496 221 aa9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 OPCMLQ14982 345 aa9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 DPF1Q92782 380 aa9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 HYLS1Q96M11 299 aa9.59□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.58□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.58□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 BCL2L11O43521 198 aa9.58□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 DFFBO76075 338 aa9.58□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 PF4P02776 101 aa9.58□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 LINC00869P0C866 280 aa9.58□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 STPG3Q8N7X2 389 aa9.58□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 RFNGQ9Y644 331 aa9.58□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 MPDU1O75352 247 aa9.57□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 IL4P05112 153 aa9.57□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 RD3LP0DJH9 198 aa9.57□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 CAMLGP49069 296 aa9.57□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 PRR31Q5SQ13 230 aa9.57□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 MIC13Q5XKP0 118 aa9.57□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.57□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.57□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.57□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 RNF125Q96EQ8 232 aa9.57□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 RSG1Q9BU20 258 aa9.57□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 ARV1Q9H2C2 271 aa9.57□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 A0A0D9SG52 128 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 C2orf70A6NJV1 201 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 OVOL1O14753 267 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 PFDN1O60925 122 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 SCGB2A1O75556 95 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 YIF1AO95070 293 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 CSN3P07498 182 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 PLP1P60201 277 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 SELENOTP62341 195 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF266Q14584 549 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 TM4SF20Q53R12 229 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 TMUB2Q71RG4 321 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 ARL6Q9H0F7 186 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 TAAR5O14804 337 aa9.55□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 C8orf88P0DMB2 117 aa9.55□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 ELLP55199 621 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.55□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.55□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 PATE2Q6UY27 113 aa9.55□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 Q8WTZ3 238 aa9.55□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.55□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.55□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 U3KQE9 123 aa9.55□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF320A2RRD8 509 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 K7EMT4 169 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 IFNA5P01569 189 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 FABP1P07148 127 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 CRYBB3P26998 211 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 ATP6V0CP27449 155 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 LYZP61626 148 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 STOML3Q8TAV4 291 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 GINS3Q9BRX5 216 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 DOK5Q9P104 306 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.54□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.53□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.53□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 WIPF1O43516 503 aa9.53□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 FOLR2P14207 255 aa9.53□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 B2MP61769 119 aa9.53□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 RAB31Q13636 194 aa9.53□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 MORN5Q5VZ52 161 aa9.53□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.53□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 PBDC1Q9BVG4 233 aa9.53□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 VSIRQ9H7M9 311 aa9.53□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.53□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 MLXQ9UH92 298 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms