RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa3.81□□□□□ -1.8
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TSG101-211ENST00000580814 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
TSG101-211ENST00000580814 NISCHQ9Y2I1 1504 aa3.81□□□□□ -1.8
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TSG101-211ENST00000580814 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.79□□□□□ -1.8
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TSG101-211ENST00000580814 C16orf95Q9H693 158 aa3.78□□□□□ -1.8
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TSG101-211ENST00000580814 ZNF835Q9Y2P0 537 aa3.78□□□□□ -1.8
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TSG101-211ENST00000580814 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.77□□□□□ -1.81
TSG101-211ENST00000580814 LEPROTO15243 131 aa3.77□□□□□ -1.81
TSG101-211ENST00000580814 IGLV3-25P01717 112 aa3.77□□□□□ -1.81
TSG101-211ENST00000580814 PMP2P02689 132 aa3.77□□□□□ -1.81
TSG101-211ENST00000580814 C1QAP02745 245 aa3.77□□□□□ -1.81
TSG101-211ENST00000580814 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
TSG101-211ENST00000580814 CRISP3P54108 245 aa3.77□□□□□ -1.81
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