RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521038.5

PHF20L1-217, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, human

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 427 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20L1-217	ENST00000521038	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	RLN3	Q8WXF3	142 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	RPE	Q96AT9	228 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	RITA1	Q96K30	269 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	S1PR3	Q99500	378 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038		A0A1B0GX51	115 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038		A8MWV9	139 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	RRH	O14718	337 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	SPINK4	O60575	86 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	DPM2	O94777	84 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	NGF	P01138	241 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	LTA	P01374	205 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	HERV-K104	P63124	156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	BAD	Q92934	168 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	PTH2	Q96A98	100 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF488	Q96MN9	340 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038		U3KQK5	164 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	ACTL6B	O94805	426 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGKC	P01834	107 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	ACYP1	P07311	99 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	MEOX1	P50221	254 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	PMVK	Q15126	192 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	MED12L	Q86YW9	2145 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	DUX1	O43812	170 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	OR2H2	O95918	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	MYCNOS	P40205	109 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	NMU	P48645	174 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	CD69	Q07108	199 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	WFDC2	Q14508	124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PHF20L1-217	ENST00000521038	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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