RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 TNXAQ16473 311 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-221ENST00000511747 PERPQ96FX8 193 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-221ENST00000511747 IGLC7A0M8Q6 106 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-221ENST00000511747 LOXP28300 417 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-221ENST00000511747 CAMPP49913 170 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-221ENST00000511747 ETFRF1Q6IPR1 90 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-221ENST00000511747 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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SH3BP2-221ENST00000511747 IGLC3P0DOY3 106 aa21.69■■□□□ 1.06
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SH3BP2-221ENST00000511747 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa21.68■■□□□ 1.06
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SH3BP2-221ENST00000511747 ATOH7Q8N100 152 aa21.68■■□□□ 1.06
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SH3BP2-221ENST00000511747 TXN2Q99757 166 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM133Q9H2Q1 129 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-221ENST00000511747 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa21.65■■□□□ 1.06
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SH3BP2-221ENST00000511747 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
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SH3BP2-221ENST00000511747 GTSF1Q8WW33 167 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-221ENST00000511747 Q9H3A6 140 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-221ENST00000511747 DYNLRB1Q9NP97 96 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-221ENST00000511747 SIGLEC9Q9Y336 463 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-221ENST00000511747 TCRAP04437 139 aa21.62■■□□□ 1.05
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