RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498331.1

CLASP2-224, Transcript of cytoplasmic linker associated protein 2, human

TSL 4

Gene CLASP2, Length 452 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLASP2-224	ENST00000498331	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	AP4M1	O00189	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	CLN5	O75503	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	YIF1A	O95070	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	CD5	P06127	495 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	LINC00869	P0C866	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	OR10J1	P30954	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	FHIT	P49789	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	RND2	P52198	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	MFAP4	P55083	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	RHOB	P62745	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	PFDN5	Q99471	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	MTOR	P42345	2549 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLASP2-224	ENST00000498331	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331		A0A1W2PPV4	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	CLDN34	H7C241	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	IFNA1	P01562	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	OR5G3	P0C626	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	S100A7	P31151	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	PSMB3	P49720	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	TAS2R45	P59539	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	FHL2	Q14192	279 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	PEA15	Q15121	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	OR2C1	O95371	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	CXorf1	O96002	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	TOMM40	O96008	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	SLPI	P03973	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	APELA	P0DMC3	54 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	ZP3	P21754	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLASP2-224	ENST00000498331	LY6E	Q16553	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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