RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 HYPMO75409 117 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2J3O76001 311 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 AMY1AP04745 511 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLC1P0CG04 106 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 MED14OSP0DP75 135 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 ORM2P19652 201 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 IER3P46695 156 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 KLK9Q2XQG4 91 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 NECAP1Q8NC96 275 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8WTZ3 238 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCA1O95477 2261 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01548A6NM66 108 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM250H0YL14 139 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 PAGE4O60829 102 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.93□□□□□ -1.142e-7■□□□□ 8
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFB8O95169 186 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 FSHBP01225 129 aa7.93□□□□□ -1.14
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RABGGTB-201ENST00000319942 IGF1P05019 195 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 GCHFRP30047 84 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 CEBPGP53567 150 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 PLP1P60201 277 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 Q56UQ5 140 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 CST9LP1Q5W188 147 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.93□□□□□ -1.14
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RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 G3V318 75 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 AP4M1O00189 453 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE6DO43924 150 aa7.92□□□□□ -1.14
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RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1-17P01599 117 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV4-59P01825 116 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 PSG1P11464 419 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 S100A7P31151 101 aa7.92□□□□□ -1.14
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RABGGTB-201ENST00000319942 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.92□□□□□ -1.14
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RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.91□□□□□ -1.14
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RABGGTB-201ENST00000319942 BLCAPP62952 87 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 C15orf32Q32M92 178 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 PATE2Q6UY27 113 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4F5Q8NH21 305 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 UHRF2Q96PU4 802 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4F4Q96R69 305 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP6V0BQ99437 205 aa7.91□□□□□ -1.14
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RABGGTB-201ENST00000319942 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF24Q9Y225 148 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.91□□□□□ -1.14
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RABGGTB-201ENST00000319942 F6UZH7 168 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BUA1 57 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R036 132 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 LYZP61626 148 aa7.9□□□□□ -1.14
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RABGGTB-201ENST00000319942 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 USMG5Q96IX5 58 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 MS4A10Q96PG2 267 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 PAXXQ9BUH6 204 aa7.9□□□□□ -1.14
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