RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 PFDN2Q9UHV9 154 aa15□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 GNG7O60262 68 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 GPR183P32249 361 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 AKR1C1Q04828 323 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 RAB31Q13636 194 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 OR2T8A6NH00 312 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 TRBV12-3P01733 135 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 CAMLGP49069 296 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF616Q08AN1 781 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 THAP8Q8NA92 274 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 A0A087WW49 117 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 LINC01619G3V211 115 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 TGOLN2O43493 480 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 CTSGP08311 255 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 IGLC1P0CG04 106 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 TEPPQ6URK8 271 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 PPP5D1E7EU14 171 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 ATP6V1G1O75348 118 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 MBP02144 154 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 CD33P20138 364 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 OR10J1P30954 320 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 ADMP35318 185 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 ARL3P36405 182 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 FHL3Q13643 280 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 SPSB3Q6PJ21 355 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXD11-201ENST00000249504 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZRG5 221 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 COMMD7Q86VX2 200 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 ZFP92A6NM28 416 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 BMPR1BO00238 502 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 SCGB2A1O75556 95 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV1-17P01599 117 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 TIGITQ495A1 244 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 TRGV9Q99603 122 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 RFNGQ9Y644 331 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 ZP3P21754 424 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 SLURP1P55000 103 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 FFAR4Q5NUL3 377 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 MGST2Q99735 147 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 AGPAT2O15120 278 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF90Q03938 601 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 RPEL1Q2QD12 228 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 TEX46H3BTG2 121 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 LYPD6BQ8NI32 183 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 MARC2Q969Z3 335 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 HRH4Q9H3N8 390 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 OR2C1O95371 312 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 TOMM40O96008 361 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 FHITP49789 147 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 RAB2AP61019 212 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 RELQ04864 619 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 RPRMQ9NS64 109 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 VWFP04275 2813 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 HBE1P02100 147 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 FABP1P07148 127 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 M6PRP20645 277 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 CITED4Q96RK1 184 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD11-201ENST00000249504 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD11-201ENST00000249504 RAB19A4D1S5 217 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD11-201ENST00000249504 RD3LP0DJH9 198 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD11-201ENST00000249504 PSG1P11464 419 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 280 ms