RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 Q56UQ5 140 aa9.65□□□□□ -0.86
DNMT1-208ENST00000586667 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.65□□□□□ -0.86
DNMT1-208ENST00000586667 TREML4Q6UXN2 200 aa9.65□□□□□ -0.86
DNMT1-208ENST00000586667 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.65□□□□□ -0.86
DNMT1-208ENST00000586667 OR11H1Q8NG94 326 aa9.65□□□□□ -0.86
DNMT1-208ENST00000586667 SLC35E1Q96K37 410 aa9.65□□□□□ -0.86
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DNMT1-208ENST00000586667 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.64□□□□□ -0.87
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DNMT1-208ENST00000586667 SLURP1P55000 103 aa9.64□□□□□ -0.87
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DNMT1-208ENST00000586667 LINC01619G3V211 115 aa9.63□□□□□ -0.87
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DNMT1-208ENST00000586667 S100A11P31949 105 aa9.63□□□□□ -0.87
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DNMT1-208ENST00000586667 ZNF345Q14585 488 aa9.63□□□□□ -0.87
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DNMT1-208ENST00000586667 LILRB2Q8N423 598 aa9.63□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 OR1S2Q8NGQ3 325 aa9.63□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.63□□□□□ -0.87
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DNMT1-208ENST00000586667 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.62□□□□□ -0.87
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DNMT1-208ENST00000586667 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
DNMT1-208ENST00000586667 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.6□□□□□ -0.87
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DNMT1-208ENST00000586667 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
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