RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 P2RY1P47900 373 aa16.58■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 RPL11P62913 178 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 RARRES2Q99969 163 aa16.58■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 PRR13Q9NZ81 148 aa16.58■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 CEBPZOSA8MTT3 80 aa16.57■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 H3BMQ9 156 aa16.57■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 SLC25A4P12235 298 aa16.57■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 RND2P52198 227 aa16.57■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 NMSQ5H8A3 153 aa16.57■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 OR1S2Q8NGQ3 325 aa16.57■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 RABAC1Q9UI14 185 aa16.57■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 CA1P00915 261 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 SULT1A3P0DMM9 295 aa16.56■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 SULT1A4P0DMN0 295 aa16.56■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 TNFSF8P32971 234 aa16.56■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 DCANP1Q8TF63 244 aa16.56■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 GRAMD2BQ96HH9 432 aa16.56■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa16.56■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 NXPH3O95157 252 aa16.55■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 STXBP6Q8NFX7 210 aa16.55■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 OR11H2Q8NH07 326 aa16.55■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 CACFD1Q9UGQ2 172 aa16.55■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa16.55■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 A0A0B4J2A0 478 aa16.54■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 NPY1RP25929 384 aa16.54■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 OR10J1P30954 320 aa16.54■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 SCGB3A2Q96PL1 93 aa16.54■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 HSPB7Q9UBY9 170 aa16.54■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 SHPKQ9UHJ6 478 aa16.54■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 FABP12A6NFH5 140 aa16.53■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 LY6G6CO95867 125 aa16.53■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 Q8WTZ3 238 aa16.53■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 GLMPQ8WWB7 406 aa16.53■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 MCUBQ9NWR8 336 aa16.53■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 CCR6P51684 374 aa16.52■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 ETFRF1Q6IPR1 90 aa16.52■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 C16orf54Q6UWD8 224 aa16.52■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 LYZL2Q7Z4W2 148 aa16.52■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 STHQ8IWL8 128 aa16.52■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 NPIPB3Q92617 1050 aa16.52■□□□□ 0.24
ZBED3-203ENST00000511587 NOL3O60936 208 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF688P0C7X2 276 aa16.51■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 AKR1C4P17516 323 aa16.51■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 SMCO1Q147U7 214 aa16.51■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 NOXA1Q86UR1 476 aa16.51■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 MCFD2Q8NI22 146 aa16.51■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 TRIM63Q969Q1 353 aa16.51■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 HELTA6NFD8 242 aa16.5■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 TOMM40O96008 361 aa16.5■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 IL4P05112 153 aa16.5■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 DTD1Q8TEA8 209 aa16.5■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 RBKSQ9H477 322 aa16.5■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 U3KQ87 197 aa16.5■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 KNCNA6PVL3 124 aa16.49■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 IFNA10P01566 189 aa16.49■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 SRPXP78539 464 aa16.49■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 LGI3Q8N145 548 aa16.49■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 C11orf45Q8TAV5 145 aa16.49■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 ACY3Q96HD9 319 aa16.49■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 AGRNO00468 2067 aa16.49■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 SPP1P10451 314 aa16.48■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 ANXA3P12429 323 aa16.48■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 C4BPBP20851 252 aa16.48■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 DHRS2Q13268 280 aa16.48■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 TMEM41BQ5BJD5 291 aa16.48■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 Q8NAQ8 132 aa16.48■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 MFFQ9GZY8 342 aa16.48■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 V9GYH0 126 aa16.48■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 DEFB4AO15263 64 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 BUB3O43684 328 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 PITX3O75364 302 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 RD3LP0DJH9 198 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 PSG1P11464 419 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 FAUP35544 74 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-203ENST00000511587 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-203ENST00000511587 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF79Q15937 498 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-203ENST00000511587 TMEM128Q5BJH2 165 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-203ENST00000511587 ACTL10Q5JWF8 245 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-203ENST00000511587 FBXL17Q9UF56 701 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-203ENST00000511587 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
ZBED3-203ENST00000511587 FAM90A26D6RGX4 464 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.5 ms