RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490322.1

SMYD3-215, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-215ENST00000490322 MOB3BQ86TA1 216 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF429Q86V71 674 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 PDPNQ86YL7 162 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 LINC00311Q8N616 119 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 COMMD1Q8N668 190 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF525Q8N782 197 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 LFNGQ8NES3 379 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 OR10P1Q8NGE3 313 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 OR13D1Q8NGV5 346 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 OR2G3Q8NGZ4 309 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 OR52E5Q8NH55 327 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 OR9G1Q8NH87 305 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 FAM213BQ8TBF2 198 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF596Q8TC21 504 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 TNFRSF14Q92956 283 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 LHX4Q969G2 390 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 OR4C12Q96R67 309 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF251Q9BRH9 671 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM147Q9BVK8 224 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 SH3BGRL3Q9H299 93 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM133Q9H2Q1 129 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 HIPK2Q9H2X6 1198 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 Q9HAA7 133 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 TREM1Q9NP99 234 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 ENY2Q9NPA8 101 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 WASHC3Q9Y3C0 194 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 TIMM9Q9Y5J7 89 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 RELNP78509 3460 aa2.26□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 TRAV3A0A0B4J244 114 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 BTBD17A6NE02 478 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 C17orf112F2Z3M2 114 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 F8W036 122 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 H0YJW9 148 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 C19orf84I3L1E1 186 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 UPK2O00526 184 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 AGPAT2O15120 278 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 LY6HO94772 140 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 KBTBD11O94819 623 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 IFNA1P01562 189 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 IFNA10P01566 189 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 APOC3P02656 99 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 ARG1P05089 322 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 SOD3P08294 240 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 CT45A6P0DMU7 189 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 CT45A5P0DMU8 189 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 CT45A7P0DMV0 189 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 FGF7P21781 194 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 USF1P22415 310 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 NPY1RP25929 384 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 SNCAP37840 140 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 REG1BP48304 166 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF137PP52743 207 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 EFNA4P52798 201 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 XGP55808 180 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 SEC61GP60059 68 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 SERF2P84101 59 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 PRCDQ00LT1 54 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 DEFA5Q01523 94 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 AKR1C1Q04828 323 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 ARL16Q0P5N6 197 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 PEA15Q15121 130 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 HLA-DRB5Q30154 266 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 ABHD12Q8N2K0 398 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF709Q8N972 641 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 BPIFCQ8NFQ6 507 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 OR10G7Q8NGN6 311 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 OR4C13Q8NGP0 309 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 LYPD6BQ8NI32 183 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 VSTM2AQ8TAG5 236 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 NANPQ8TBE9 248 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF479Q96JC4 524 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 NABP2Q9BQ15 211 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 RSG1Q9BU20 258 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 CHRDL1Q9BU40 450 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 PBDC1Q9BVG4 233 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 HINT2Q9BX68 163 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 CLEC7AQ9BXN2 247 aa2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SMYD3-215ENST00000490322 PLEKHA3Q9HB20 300 aa2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms