RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559937.1

SMAD3-212, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-212ENST00000559937 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 TENM4Q6N022 2769 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 FLNCQ14315 2725 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 ROS1P08922 2347 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 COL12A1Q99715 3063 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 MAST4O15021 2626 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 PTPN13Q12923 2485 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 A0A1W2PPI3 338 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 IFITM10A6NMD0 228 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 LY6LH3BQJ8 138 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 SIAH2O43255 324 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 LIPFP07098 398 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 OR10J4P0C629 311 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 COL8A2P25067 703 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 PDLIM4P50479 330 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 PRSS8Q16651 343 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 COX19Q49B96 90 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 TEX38Q6PEX7 206 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 MOB3BQ86TA1 216 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF843Q8N446 348 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 NECAP1Q8NC96 275 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 OR1P1Q8NH06 330 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 OCC1Q8TAD7 63 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF503Q96F45 646 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 TIMD4Q96H15 378 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 DERL1Q9BUN8 251 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 NIT2Q9NQR4 276 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 E7EUB6 86 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 M0R1W7 72 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 COX7A2P2O60397 106 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 OR7C2O60412 319 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 FOXH1O75593 365 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 ACTL6BO94805 426 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 SOD3P08294 240 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 SFTPCP11686 197 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 TAS2R60P59551 318 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 OSTCQ9NRP0 149 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 IL36BQ9NZH7 164 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 HELTA6NFD8 242 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 FABP1P07148 127 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 CEACAM3P40198 252 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 GNG4P50150 75 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 PLP1P60201 277 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 CTAG1AP78358 180 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 TNXAQ16473 311 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 MLANAQ16655 118 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 TIGITQ495A1 244 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 DTX2Q86UW9 622 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 OR5T1Q8NG75 326 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 NPIPB3Q92617 1050 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 RPEQ96AT9 228 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 PERPQ96FX8 193 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-212ENST00000559937 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms