RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	AQP10	Q96PS8	301 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	NEURL2	Q9BR09	285 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	KLK15	Q9H2R5	256 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	HMSD	A8MTL9	139 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658		G3V3Q6	166 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658		I3L2K1	104 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658		K7EIM0	57 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	DFFB	O76075	338 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV3-23	P01764	117 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	CD28	P10747	220 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	NHLH2	Q02577	135 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	OR2F1	Q13607	317 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	CLINT1	Q14677	625 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	RNF152	Q8N8N0	203 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	ACY3	Q96HD9	319 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	GGACT	Q9BVM4	153 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	GNB4	Q9HAV0	340 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658		S4R3C0	116 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0D9SG52	128 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PRX2	142 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	FNDC10	F2Z333	226 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	IFNA5	P01569	189 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV3-48	P01763	117 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	RND2	P52198	227 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	CD300C	Q08708	224 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF345	Q14585	488 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	C3orf56	Q8N813	242 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	OR5B12	Q96R08	314 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	TXN2	Q99757	166 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	ATP5S	Q99766	215 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	OR2T8	A6NH00	312 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	ZFP92	A6NM28	416 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	PRSS46	E5RG02	174 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	CLN5	O75503	358 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	FABP1	P07148	127 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	C4BPB	P20851	252 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	GPR183	P32249	361 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	ARL3	P36405	182 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	ARL16	Q0P5N6	197 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF266	Q14584	549 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	OR4X1	Q8NH49	305 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	ATP6V0B	Q99437	205 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	FBXL17	Q9UF56	701 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	NF1	P21359	2839 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	RNF222	A6NCQ9	220 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	TAAR5	O14804	337 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	OR10J1	P30954	320 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	RAB31	Q13636	194 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	GAMT	Q14353	236 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	MLANA	Q16655	118 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	TEPP	Q6URK8	271 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	NPIPB3	Q92617	1050 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	DPF1	Q92782	380 aa		9.22	□□□□□ -0.93
DDB1-223	ENST00000543658	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		9.22	□□□□□ -0.93

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