RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 RCHY1Q96PM5 261 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF253O75346 499 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 AMY1AP04745 511 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM177Q53S58 311 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM168AQ92567 244 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 USF1P22415 310 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 WT1-ASQ06250 92 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF124Q15973 351 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 ASPHD1Q5U4P2 390 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF714Q96N38 554 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF2Q99496 336 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 NKX6-3A6NJ46 265 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 BMPR1BO00238 502 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 PYYP10082 97 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 TNFRSF1AP19438 455 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 KRTDAPP60985 99 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM200BQ69YZ2 307 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PS18 150 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 INS-IGF2F8WCM5 200 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 IGHV3-48P01763 117 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 HLA-DQA1P01909 254 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 SRIP30626 198 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 OR4C13Q8NGP0 309 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF586Q9NXT0 402 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 AMTP48728 403 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 Q6ZS92 163 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 NUP37Q8NFH4 326 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 NPIPB3Q92617 1050 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 NRN1Q9NPD7 142 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 COX7A2P2O60397 106 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 FCN3O75636 299 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PN81 502 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 CGB1A6NKQ9 187 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 M0QZK8 103 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 C10orf55Q5SWW7 151 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 C10orf113Q5VZT2 155 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNS1Q96KK3 526 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 NAV3Q8IVL0 2385 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 IZUMO1RA6ND01 250 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 PATE2Q6UY27 113 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 PAXXQ9BUH6 204 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM108Q6UXF1 575 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 OR10X1Q8NGY0 326 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 C17orf100A8MU93 164 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 DIRC3C9JPN6 131 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 G0S2P27469 103 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 Q8N976 141 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 APCSP02743 223 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 PMCHP20382 165 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 VSTM2AQ8TAG5 236 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 OR1L4Q8NGR5 311 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAV34A0A0B4J273 112 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 ADIPOQQ15848 244 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF329Q86UD4 541 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 SLAQ13239 276 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 IGF2-ASQ6U949 168 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 OR4A5Q8NH83 315 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 DCHS1Q96JQ0 3298 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 K7EM74 188 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 PDPNQ86YL7 162 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 PEX7O00628 323 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 FSTL3O95633 263 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 IGLV2-23P01705 113 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 BPIFB3P59826 476 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-221ENST00000511747 PPIAL4EA0A075B759 164 aa21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 PPIAL4DF5H284 164 aa21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 PPIAL4FP0DN26 164 aa21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM231DQ6ZW35 169 aa21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 NUDT10Q8NFP7 164 aa21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM186Q96B77 213 aa21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 FXYD5Q96DB9 178 aa21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 MBD6Q96DN6 1003 aa21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 NUDT11Q96G61 164 aa21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 PPIAL4AQ9Y536 164 aa21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 PLXNB1O43157 2135 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 CRYABP02511 175 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 FOSL1P15407 271 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM19A2Q8N3H0 131 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-221ENST00000511747 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.7 ms