RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 MISP3Q96FF7 219 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 HSPB11Q9Y547 144 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 VWFP04275 2813 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 IGSF23A1L1A6 192 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 PRSS46E5RG02 174 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 I3L2K1 104 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 DFFBO76075 338 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 OPRK1P41145 380 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 NPBWR1P48145 328 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 MFAP2P55001 183 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 TPPP2P59282 170 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 SLC35E1Q96K37 410 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 MFFQ9GZY8 342 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 TNCP24821 2201 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 K7EIM0 57 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 ARPC5O15511 151 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 OR2J3O76001 311 aa9.1□□□□□ -0.95
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NISCH-211ENST00000488243 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 MFAP4P55083 255 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 SLC38A11Q08AI6 406 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 VWC2Q2TAL6 325 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 C15orf32Q32M92 178 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 OR8G2PQ6IF36 304 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 ZNF329Q86UD4 541 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 LILRB2Q8N423 598 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 ZNF491Q8N8L2 437 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 OR4X1Q8NH49 305 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 C21orf62Q9NYP8 219 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 RNF222A6NCQ9 220 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 SMLR1H3BR10 107 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 MPDU1O75352 247 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 CST7O76096 145 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 NDUFB8O95169 186 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 FABP1P07148 127 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 RUNX1Q01196 453 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 NHLH2Q02577 135 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 ZNF266Q14584 549 aa9.09□□□□□ -0.95
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NISCH-211ENST00000488243 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 MS4A10Q96PG2 267 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
NISCH-211ENST00000488243 IFNA5P01569 189 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 PRH1P02810 166 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 RAB31Q13636 194 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 GAMTQ14353 236 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 ACSM6Q6P461 480 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 ATP5SQ99766 215 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 KLK15Q9H2R5 256 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 RYR3Q15413 4870 aa9.07□□□□□ -0.96
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NISCH-211ENST00000488243 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 GNG7O60262 68 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 CLN5O75503 358 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 JTBO76095 146 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 CFDP00746 253 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 ARL16Q0P5N6 197 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 TEPPQ6URK8 271 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 THAP8Q8NA92 274 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
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