RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
NEK1-201ENST00000439128 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
NEK1-201ENST00000439128 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.96□□□□□ -0.81
NEK1-201ENST00000439128 CCL1P22362 96 aa9.96□□□□□ -0.81
NEK1-201ENST00000439128 RND3P61587 244 aa9.96□□□□□ -0.81
NEK1-201ENST00000439128 NDPQ00604 133 aa9.96□□□□□ -0.81
NEK1-201ENST00000439128 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.96□□□□□ -0.81
NEK1-201ENST00000439128 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.96□□□□□ -0.81
NEK1-201ENST00000439128 GGACTQ9BVM4 153 aa9.96□□□□□ -0.81
NEK1-201ENST00000439128 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa9.96□□□□□ -0.81
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NEK1-201ENST00000439128 ZMAT4Q9H898 229 aa9.96□□□□□ -0.82
NEK1-201ENST00000439128 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
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NEK1-201ENST00000439128 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.96□□□□□ -0.82
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NEK1-201ENST00000439128 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.95□□□□□ -0.82
NEK1-201ENST00000439128 REC114Q7Z4M0 266 aa9.95□□□□□ -0.82
NEK1-201ENST00000439128 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.95□□□□□ -0.82
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NEK1-201ENST00000439128 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.93□□□□□ -0.82
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NEK1-201ENST00000439128 RNF5Q99942 180 aa9.93□□□□□ -0.82
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NEK1-201ENST00000439128 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.93□□□□□ -0.82
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NEK1-201ENST00000439128 SLX1AQ9BQ83 275 aa9.92□□□□□ -0.82
NEK1-201ENST00000439128 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
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NEK1-201ENST00000439128 A0A087WV48 116 aa9.92□□□□□ -0.82
NEK1-201ENST00000439128 TMEM218A2RU14 115 aa9.92□□□□□ -0.82
NEK1-201ENST00000439128 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
NEK1-201ENST00000439128 ZNF383Q8NA42 475 aa9.92□□□□□ -0.82
NEK1-201ENST00000439128 OR4D5Q8NGN0 318 aa9.92□□□□□ -0.82
NEK1-201ENST00000439128 DEFB130BP0DP73 79 aa9.92□□□□□ -0.82
NEK1-201ENST00000439128 DEFB130AP0DP74 79 aa9.92□□□□□ -0.82
NEK1-201ENST00000439128 RNF151Q2KHN1 245 aa9.92□□□□□ -0.82
NEK1-201ENST00000439128 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.92□□□□□ -0.82
NEK1-201ENST00000439128 COPS9Q8WXC6 57 aa9.92□□□□□ -0.82
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