RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ARPC1AQ92747 370 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 ACY3Q96HD9 319 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM68Q96MH6 324 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 MGST2Q99735 147 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 SSX3Q99909 188 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 VSIRQ9H7M9 311 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0U1RQK1 487 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GV50 99 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM218A2RU14 115 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 CD5P06127 495 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 APELAP0DMC3 54 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 ZP3P21754 424 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 SELENOTP62341 195 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 MIC13Q5XKP0 118 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8N9W7 124 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 NANPQ8TBE9 248 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 NPIPB3Q92617 1050 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB24Q969Q5 203 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 THYN1Q9P016 225 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 U3KQE9 123 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP92A6NM28 416 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 NPIPB6E9PJ23 425 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 M0QZK8 103 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 MT-CO2P00403 227 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 IFNA1P01562 189 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYGCP07315 174 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV4-31P0DP07 118 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 CTRB1P17538 263 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10J1P30954 320 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 RHOBP62745 196 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL20P78556 96 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 PMS2P11Q13670 270 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 CTRB2Q6GPI1 263 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX29Q8N6K0 151 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 STPG3Q8N7X2 389 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC14L6B5MCN3 397 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 F8W036 122 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 FABP1P07148 127 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 PPT1P50897 306 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 RND2P52198 227 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM122CQ6P4D5 195 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35E3Q7Z769 313 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM116Q8NCL8 245 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00052Q96N35 136 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF2Q99496 336 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 MOB4Q9Y3A3 225 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 YIF1AO95070 293 aa7.99□□□□□ -1.13
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RABGGTB-201ENST00000319942 MFAP2P55001 183 aa7.99□□□□□ -1.13
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RABGGTB-201ENST00000319942 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 KHDC3LQ587J8 217 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 THAP8Q8NA92 274 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4X1Q8NH49 305 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 PIFOQ8TCI5 191 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TRGV9Q99603 122 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC11CQ9BY50 192 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.99□□□□□ -1.13
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RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 SCGB2A1O75556 95 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00869P0C866 280 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-201ENST00000319942 NPBWR1P48145 328 aa7.98□□□□□ -1.13
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