RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 OR1L8Q8NGR8 309 aa22.04■■□□□ 1.12
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SH3BP2-221ENST00000511747 NAT8BQ9UHF3 227 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC35B1P78383 322 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-221ENST00000511747 SAMD10Q9BYL1 202 aa22.03■■□□□ 1.12
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SH3BP2-221ENST00000511747 MIEN1Q9BRT3 115 aa21.94■■□□□ 1.1
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SH3BP2-221ENST00000511747 CA1P00915 261 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-221ENST00000511747 VAMP8Q9BV40 100 aa21.93■■□□□ 1.1
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