RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574453.5

MINK1-209, Transcript of misshapen like kinase 1, human

TSL 1 (best)

Gene MINK1, Length 4,941 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MINK1-209	ENST00000574453	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	HBB	P68871	147 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	WDR82	Q6UXN9	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	RFNG	Q9Y644	331 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	ATG101	Q9BSB4	218 aa		13.52	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		13.52	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		13.52	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	HLA-DRB1	P01911	266 aa		13.52	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		13.52	□□□□□ -0.24
MINK1-209	ENST00000574453	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453		K7ERU9	68 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25	2e-8	■■■□□ 18.5
MINK1-209	ENST00000574453	C2orf83	Q53S99	150 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	TCF23	Q7RTU1	214 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	METTL26	Q96S19	204 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	FBXL15	Q9H469	300 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	LIPF	P07098	398 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	PEX7	O00628	323 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	UBE2C	O00762	179 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	TM4SF5	O14894	197 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	PF4V1	P10720	104 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	DLX1	P56177	255 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453		S4R3C0	116 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	GAGE10	A6NGK3	116 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	TFPI2	P48307	235 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	GFRA1	P56159	465 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	TBR1	Q16650	682 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	MORN2	Q502X0	79 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	CCL3L1	P16619	93 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	THADA	Q6YHU6	1953 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	YPEL1	O60688	119 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	ANOS1	P23352	680 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	LINC01560	Q8TB33	94 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	KCNS1	Q96KK3	526 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	YPEL2	Q96QA6	119 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	CXCL1	P09341	107 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	C14orf144	Q96I85	54 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	RAB37	Q96AX2	223 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	OR52E5	Q8NH55	327 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	SERF1A	O75920	110 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	UCN	P55089	124 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	PSG9	Q00887	426 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	CAD	P27708	2225 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453		B9A039	149 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	GCSH	P23434	173 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	NMS	Q5H8A3	153 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	C15orf61	A6NNL5	157 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	CX3CL1	P78423	397 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MINK1-209	ENST00000574453	ID1	P41134	155 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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