RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 DEFB109BQ30KR1 87 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-221ENST00000511747 STUMQ69YW2 141 aa22.13■■□□□ 1.13
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SH3BP2-221ENST00000511747 IL19Q9UHD0 177 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-221ENST00000511747 UPK2O00526 184 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-221ENST00000511747 EREGO14944 169 aa22.12■■□□□ 1.13
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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SH3BP2-221ENST00000511747 C19orf24Q9BVV8 132 aa22.06■■□□□ 1.12
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SH3BP2-221ENST00000511747 C3orf36Q3SXR2 165 aa22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP2-221ENST00000511747 BET1LQ9NYM9 111 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-221ENST00000511747 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-221ENST00000511747 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-221ENST00000511747 OR5AU1Q8NGC0 362 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-221ENST00000511747 M0R143 59 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-221ENST00000511747 TCAPO15273 167 aa22.04■■□□□ 1.12
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SH3BP2-221ENST00000511747 PNKDQ8N490 385 aa22.04■■□□□ 1.12
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