RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-204ENST00000427778 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 DHFRP00374 187 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 IFNA6P05013 189 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 AREGP15514 252 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 ERVK-16P61578 105 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 MEF2DQ14814 521 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 C15orf32Q32M92 178 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 TERB2Q8NHR7 220 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 SOSTQ9BQB4 213 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 DPPA5A6NC42 116 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 H0Y980 276 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 SAP30O75446 220 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 B3GALNT1O75752 331 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 TRBV12-3P01733 135 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 PRH1P02810 166 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 RPA2P15927 270 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 ECI1P42126 302 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 LPAR6P43657 344 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 DEFA5Q01523 94 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 ATP5G2Q06055 141 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 OR5B3Q8NH48 314 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 MCFD2Q8NI22 146 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 SEC22AQ96IW7 307 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 TSC22D3Q99576 134 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 PRNDQ9UKY0 176 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 C15orf61A6NNL5 157 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 BMPR1BO00238 502 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 RAB3DO95716 219 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 KRASP01116 189 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 IGKV1-39P01597 117 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 IGLV1-51P01701 117 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 IGKV1D-39P04432 117 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 P0C879 139 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 MYOD1P15172 320 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 TNFSF8P32971 234 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 G6PCP35575 357 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 PIGPP57054 158 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 WT1-ASQ06250 92 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 CD69Q07108 199 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 IL18Q14116 193 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 ATP6V0BQ99437 205 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 B9D2Q9BPU9 175 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 A6NJY4 79 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 CYB5BO43169 146 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 SNAPC5O75971 98 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 OR2J3O76001 311 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 SERPINE2P07093 398 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 AKAIN1P0CW23 69 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 PGAM2P15259 253 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 UCP1P25874 307 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 SYNJ2BPP57105 145 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 RPEL1Q2QD12 228 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-204ENST00000427778 CXorf58Q96LI9 332 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms