RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592097.5

NEDD4L-234, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-234	ENST00000592097	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	FCGR1A	P12314	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	PSME3	P61289	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	MED21	Q13503	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	GINS1	Q14691	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	SSX6	Q7RTT6	188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	GPER1	Q99527	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	REEP1	Q9H902	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-234	ENST00000592097	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	CCDC22	O60826	627 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	OR2J3	O76001	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	PRH1	P02810	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	MAS1	P04201	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	ISG15	P05161	165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	GAL	P22466	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	TBX5	Q99593	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	CA11	O75493	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	SULT1C4	O75897	302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	SERPINA2	P20848	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	NPY1R	P25929	384 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	GNGT1	P63211	74 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	GK3P	Q14409	553 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	TNXA	Q16473	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	GAPT	Q8N292	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	CAPG	P40121	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	CRISP1	P54107	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	XG	P55808	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	CDK5	Q00535	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	CBX3	Q13185	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	CTF1	Q16619	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-234	ENST00000592097	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 594 ms