RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBR1Q16650 682 aa13.56□□□□□ -0.24
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RBPJQ06330 500 aa13.5□□□□□ -0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa13.5□□□□□ -0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MGST2Q99735 147 aa13.5□□□□□ -0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMIM7Q9BQ49 75 aa13.5□□□□□ -0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPVFQ9HCQ7 196 aa13.5□□□□□ -0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NGBQ9NPG2 151 aa13.5□□□□□ -0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRNDQ9UKY0 176 aa13.5□□□□□ -0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa13.5□□□□□ -0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FCN3O75636 299 aa13.5□□□□□ -0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 YIF1AO95070 293 aa13.5□□□□□ -0.25
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