RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565712.1

C15orf40-211, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene C15orf40, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-211ENST00000565712 RAB25P57735 213 aa11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 HERV-K104P61576 105 aa11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 RUNX1Q01196 453 aa11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 DYRK1AQ13627 763 aa11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 PRSS8Q16651 343 aa11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 FOXB2Q5VYV0 432 aa11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 DHRS11Q6UWP2 260 aa11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 GPX8Q8TED1 209 aa11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 SLA2Q9H6Q3 261 aa11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 GNB4Q9HAV0 340 aa11.43□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 I3L521 148 aa11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 TNFSF12O43508 249 aa11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 RPL5P46777 297 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 TMBIM6P55061 237 aa11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 CATR1Q13166 79 aa11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 TMEM17Q86X19 198 aa11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 OR11H1Q8NG94 326 aa11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 OR1N2Q8NGR9 330 aa11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 VSTM2AQ8TAG5 236 aa11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 DPF1Q92782 380 aa11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.42□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 H3BUA1 57 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 ACTL6BO94805 426 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 TPPPO94811 219 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 HRASP01112 189 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 OR8U8P0C7N1 319 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 HLA-DMAP28067 261 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 RCVRNP35243 200 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 TPPP2P59282 170 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 FHL3Q13643 280 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 SPCS2Q15005 226 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 TNXAQ16473 311 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 IDO2Q6ZQW0 420 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 LYSMD2Q8IV50 215 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 MMD2Q8IY49 270 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 POC5Q8NA72 575 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 OR6F1Q8NGZ6 308 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 CASTOR1Q8WTX7 329 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 C15orf40Q8WUR7 153 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 MOB3AQ96BX8 217 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 OR5B12Q96R08 314 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 PHB2Q99623 299 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 AIFM2Q9BRQ8 373 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 EXTL2Q9UBQ6 330 aa11.41□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 OR2A4O95047 310 aa11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 TRGV3P03979 118 aa11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 HRH1P35367 487 aa11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 BRWD1-AS2P59051 145 aa11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF616Q08AN1 781 aa11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 OR5T1Q8NG75 326 aa11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 MS4A10Q96PG2 267 aa11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 OR2A7Q96R45 310 aa11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 GPHA2Q96T91 129 aa11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
C15orf40-211ENST00000565712 MSGN1A6NI15 193 aa11.39□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 BRI3O95415 125 aa11.39□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 GNRHRP30968 328 aa11.39□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 TSPAN5P62079 268 aa11.39□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 AADACL3Q5VUY0 350 aa11.39□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.39□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 SPAG16Q8N0X2 631 aa11.39□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 CD300LFQ8TDQ1 290 aa11.39□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 RHOVQ96L33 236 aa11.39□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 A0A0G2JLM5 398 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 MPPED1O15442 326 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 RGS5O15539 181 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 RAMP3O60896 148 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 KBTBD11O94819 623 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 HPRT1P00492 218 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 MAS1LP35410 378 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 ASPHD1Q5U4P2 390 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 CMTM1Q8IZ96 169 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 OR51H1Q8NH63 302 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 SPIN2AQ99865 258 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa11.37□□□□□ -0.59
C15orf40-211ENST00000565712 LINC01619G3V211 115 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.2 ms