RNA–Protein interactions for RNA: YNR071C

YNR071C, Transcript of Putative aldose 1-epimerase, yeast

Gene YNR071C, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR071C	YNR071C	MEH1	Q02205	184 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNR071C	YNR071C	DLT1	Q04216	342 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNR071C	YNR071C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNR071C	YNR071C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YNR071C	YNR071C	SDH5	Q08230	162 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNR071C	YNR071C	VHS3	Q08438	674 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNR071C	YNR071C	IRC13	Q08630	104 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNR071C	YNR071C	HFI1	Q12060	488 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNR071C	YNR071C	HOP1	P20050	605 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	ATP12	P22135	325 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	YKU70	P32807	602 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	BEM3	P32873	1128 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	NUP120	P35729	1037 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	OAF3	P36023	863 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	PSY4	P38193	441 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	YBR053C	P38235	358 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	VPS8	P39702	1274 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	GET2	P40056	285 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	RAD26	P40352	1085 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	MEP3	P53390	489 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	GTR1	Q00582	310 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	BLS1	Q06071	122 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	FRE5	Q08908	694 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	SSM4	P40318	1319 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	ALG7	P07286	448 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	MET3	P08536	511 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	MRP7	P12687	371 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	XRS2	P33301	854 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	BEM4	P39011	633 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	RCF1	Q03713	159 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	CIA1	Q05583	330 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	SCM3	Q12334	223 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	MSH1	P25846	959 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	PPS1	P38148	807 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	FMO1	P38866	432 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	DUN1	P39009	513 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	VID28	P40547	921 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	YIR042C	P40586	236 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	BNA1	P47096	177 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	TEP1	P53916	434 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	VPS5	Q92331	675 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	SWI6	P09959	803 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	APT2	P36973	181 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	BCD1	P38772	366 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	SFB3	P38810	929 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	HOL1	P53389	586 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	REC102	Q02721	264 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	GIS1	Q03833	894 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	HLR1	Q04429	423 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	MCM21	Q06675	368 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	STP4	Q07351	490 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	HOM3	P10869	527 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	NPL6	P32832	435 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	APE4	P38821	490 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	ERR3	P42222	437 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	YJL163C	P46996	555 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	ASK10	P48361	1146 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	MUK1	Q02866	612 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	ARP7	Q12406	477 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	CDC26	P14724	124 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	DAL5	P15365	543 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	SDS22	P36047	338 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.35	□□□□□ -1.71	not detected
YNR071C	YNR071C	GID8	P40208	455 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	AMA1	P50082	593 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	RNT1	Q02555	471 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	TIM50	Q02776	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YNR071C	YNR071C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.35	□□□□□ -1.71	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 97.5 ms