RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL050CYKL050C GYP8P43570 497 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C YNR061CP53747 219 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C RCM1P53972 490 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C ATP25Q03153 612 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C YHM2Q04013 314 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C LCD1Q04377 747 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C YDR338CQ05497 695 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C NBA1Q08229 501 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C NUR1Q12066 484 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C GCN4P03069 281 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C POL3P15436 1097 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C OLE1P21147 510 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C UBC1P21734 215 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C SLA1P32790 1244 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C SDS22P36047 338 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C YBR238CP38330 731 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C BSD2P38356 321 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C LAM1P38851 1228 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C SMC2P38989 1170 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C UME6P39001 836 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C OGG1P53397 376 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C ARE2P53629 642 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C JJJ1P53863 590 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C EOS1P53938 366 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C SSL2Q00578 843 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C RTN2Q12443 393 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C FRE6Q12473 712 aa3.95□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C MET17P06106 444 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C RPB4P20433 221 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C LCB1P25045 558 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C SED4P25365 1065 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C PYC2P32327 1180 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C LOT5P34234 306 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C ATG19P35193 415 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C RTS1P38903 757 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C YIL161WP40449 235 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C MKT1P40850 830 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C LCB2P40970 561 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C HNT2P49775 206 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C FOL2P51601 243 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C PIL1P53252 339 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C DAM1P53267 343 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C YLR345WQ06137 509 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C PHO92Q06390 306 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C HFI1Q12060 488 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C SKS1Q12505 502 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C YLL066CQ99208 1374 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C ADE8P04161 214 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C ARG3P05150 338 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C RPS9BP05755 195 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C HSF1P10961 833 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C THR1P17423 357 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C PHO3P24031 467 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C NAM7P30771 971 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C SAC6P32599 642 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C SWH1P35845 1188 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C LAS1P36146 502 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C HXT6P39003 570 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C HXT7P39004 570 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C DUN1P39009 513 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C STL1P39932 569 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data3.94□□□□□ -1.78not detected
YKL050CYKL050C NCS6P53088 359 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C YPL107WQ02873 248 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data3.94□□□□□ -1.78not detected
YKL050CYKL050C YOR296WQ08748 1289 aa3.94□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C VPS13Q07878 3144 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C DED1P06634 604 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C RPB2P08518 1224 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C AHP1P38013 176 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C CTM1P38818 585 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C BUD16P39988 312 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C SIP5P40210 489 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C ZIM17P42844 174 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C AIP1P46680 615 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C NHX1Q04121 633 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C DCS2Q12123 353 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C PET111P08468 800 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C DIT1P21623 536 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C RRP7P25368 297 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data3.93□□□□□ -1.78not detected
YKL050CYKL050C MGM1P32266 881 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C VPS17P32913 551 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C COY1P34237 679 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C ATG14P38270 344 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C MTG2P38860 518 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C YIL092WP40497 633 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C YIL089WP40500 205 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C CTF18P49956 741 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C TAD1P53065 400 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C MGR3Q04472 501 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C DUS3Q06053 668 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C EST2Q06163 884 aa3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C EMG1Q06287 252 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YKL050CYKL050C OMS1Q06668 471 aa3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.3 ms