RNA–Protein interactions for RNA: YJL197W

UBP12, Transcript of Ubiquitin-specific protease, yeast

Gene UBP12, Length 3,765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBP12	YJL197W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	MTH1	P35198	433 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	CTF13	P35203	478 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	MEP1	P40260	492 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	BST1	P43571	1029 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	SIP4	P46954	829 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YJL171C	P46992	396 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	TEL2	P53038	688 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	HSP42	Q12329	375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	ROX1	P25042	368 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	ESL2	P36168	1195 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YJL068C	P40363	299 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	ARG3	P05150	338 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	OCA4	P25366	362 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	UBP7	P40453	1071 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	SDH1	Q00711	640 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	EAR1	Q03212	550 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	FBP1	P09201	348 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	PET127	P32606	800 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	LYS14	P40971	790 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	ZDS2	P54786	942 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	ORC4	P54791	529 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YML119W	Q03208	357 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	STP4	Q07351	490 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YJR061W	P40355	935 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	VPS75	P53853	264 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	RMT2	Q03305	412 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	PPN1	Q04119	674 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	RCO1	Q04779	684 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	OPT2	Q06593	877 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	PUP2	P32379	260 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	ORC2	P32833	620 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	SCW11	P53189	542 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	SSL2	Q00578	843 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YPS7	Q06325	596 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	HUA2	Q12134	243 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	HOS1	Q12214	470 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	SVS1	Q12254	260 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	RTN2	Q12443	393 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	HSF1	P10961	833 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	GPT2	P36148	743 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	ISA2	Q12425	185 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	PCK1	P10963	549 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	SET3	P36124	751 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YHL012W	P38709	493 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	FLC2	P39719	783 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	NMD4	Q12129	218 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	RIT1	P23796	513 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	RRF1	P38771	230 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	CEM1	P39525	442 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	CAB2	P40506	365 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	TAF4	P50105	388 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	PKH1	Q03407	766 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	TPK1	P06244	397 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	SAM35	P14693	329 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	ALG14	P38242	237 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	POP2	P39008	433 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	ROG3	P43602	733 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
UBP12	YJL197W	XYL2	Q07993	356 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	RCN2	Q12044	265 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	MET17	P06106	444 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	IME1	P21190	360 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	MDL1	P33310	695 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	CTF8	P38877	133 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBP12	YJL197W	SPO22	P40511	975 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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