RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR056CYFR056C NUP1P20676 1076 aa2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C EUG1P32474 517 aa2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C MAL31P38156 614 aa2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YBR071WP38243 211 aa2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C COS111P38308 924 aa2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C NOP2P40991 618 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YJR039WP47107 1121 aa2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C DIP5P53388 608 aa2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C NGL2Q03264 515 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C HFD1Q04458 532 aa2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C VBA4Q04602 768 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YFT2Q06676 274 aa2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C GUD1Q07729 489 aa2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YOR378WQ08902 515 aa2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C SLX4Q12098 748 aa2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C RKI1Q12189 258 aa2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C PHO5P00635 467 aa2.85□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C TPK2P06245 380 aa2.85□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C FRS1P15624 595 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C PET127P32606 800 aa2.85□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YJR096WP47137 282 aa2.85□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C ASN1P49089 572 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YNL034WP53963 612 aa2.85□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YNL018CP53976 612 aa2.85□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YMR210WQ03649 449 aa2.85□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C UFO1Q04511 668 aa2.85□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C VPS36Q06696 566 aa2.85□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C ULA1Q12059 462 aa2.85□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C MPD2Q99316 277 aa2.85□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C PGK1P00560 416 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C KAR1P11927 433 aa2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C PRP22P24384 1145 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YMC1P32331 307 aa2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C PLC1P32383 869 aa2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C ELF1P36053 145 aa2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C FUI1P38196 639 aa2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C MIT1P40002 666 aa2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C LTP1P40347 161 aa2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C XBP1P40489 647 aa2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C NET1P47035 1189 aa2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C BIT61P47041 543 aa2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C DAK1P54838 584 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C YDR179W-AQ03983 463 aa2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C DCS2Q12123 353 aa2.84□□□□□ -1.95
YFR056CYFR056C IMG2P25642 146 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C DAL3P32459 195 aa2.83□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C CKB2P38930 258 aa2.83□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C PEA2P40091 420 aa2.83□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C THI6P41835 540 aa2.83□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C GAT1P43574 510 aa2.83□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C BNA3P47039 444 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C YGR153WP48238 217 aa2.83□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C TGL2P54857 326 aa2.83□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C VPS72Q03388 795 aa2.83□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C APN1P22936 367 aa2.82□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C VPS24P36095 224 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C RIM4P38741 713 aa2.82□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C TDA3P38758 523 aa2.82□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C PXA1P41909 870 aa2.82□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C TAX4P47030 604 aa2.82□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C ATP4P05626 244 aa2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C SST2P11972 698 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C AEP2P22136 580 aa2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C TRX2P22803 104 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C PWP2P25635 923 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C MSS1P32559 526 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C YKU70P32807 602 aa2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C PIH1P38768 344 aa2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C BEM4P39011 633 aa2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C GZF3P42944 551 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C TRS23Q03784 219 aa2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C PPN1Q04119 674 aa2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C YLR407WQ06070 228 aa2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C ORM2Q06144 216 aa2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C IZH3Q07959 543 aa2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C RMP1Q12530 201 aa2.81□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C PIF1P07271 859 aa2.8□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C YPT7P32939 208 aa2.8□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C RET2P43621 546 aa2.8□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C MNN11P46985 422 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C NIT2P47016 307 aa2.8□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C SNF12P53628 566 aa2.8□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C MET14Q02196 202 aa2.8□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C ATG16Q03818 150 aa2.8□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C PHM6Q05637 104 aa2.8□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C RGT2Q12300 763 aa2.8□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C PGI1P12709 554 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C AAD3P25612 363 aa2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C NIC96P34077 839 aa2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C HOT13P36078 116 aa2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C PPE1P38796 400 aa2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C TMN3P40071 706 aa2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C GPP2P40106 250 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C CCT5P40413 562 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C DUG1P43616 481 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 448.5 ms