RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 AIDAQ96BJ3 306 aa37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 LDHBP07195 334 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL34Q8N239 644 aa37.16■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNB2Q92953 911 aa37.16■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SCN9AQ15858 1988 aa37.15■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP7A1P22680 504 aa37.15■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 RABEP1Q15276 862 aa37.15■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 GNAT2P19087 354 aa37.13■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDX5P30044 214 aa37.13■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 MECOMQ03112 1051 aa37.13■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 LAMA4Q16363 1823 aa37.13■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 GSTO1P78417 241 aa37.13■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 DOK7Q18PE1 504 aa37.12■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 MFSD14BQ5SR56 506 aa37.12■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF2IP78347 998 aa37.11■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CTNNA3Q9UI47 895 aa37.11■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIP5K2O43314 1243 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TTLL5Q6EMB2 1281 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 JAG2Q9Y219 1238 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ECE2O60344 883 aa37.09■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 LDHCP07864 332 aa37.09■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 AOC3Q16853 763 aa37.09■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CREB3L3Q68CJ9 461 aa37.09■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SLF2Q8IX21 1173 aa37.09■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 PALD1Q9ULE6 856 aa37.09■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TSGA10IPQ3SY00 556 aa37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF384Q8TF68 577 aa37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SNX14Q9Y5W7 946 aa37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMYM6O95789 1325 aa37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa37.07■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 MBD4O95243 580 aa37.07■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS53Q5VIR6 699 aa37.07■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 STRIP1Q5VSL9 837 aa37.07■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CERS3Q8IU89 383 aa37.07■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 DBNDD1Q9H9R9 158 aa37.07■■■■□ 3.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC27A2O14975 620 aa37.07■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 BECN1Q14457 450 aa37.07■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 ALX1Q15699 326 aa37.05■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRA1Q86SQ6 560 aa37.05■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 BCS1LQ9Y276 419 aa37.05■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 LTBP3Q9NS15 1303 aa37.05■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT32Q14532 448 aa37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 SNX21Q969T3 373 aa37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 TAOK3Q9H2K8 898 aa37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 TM6SF1Q9BZW5 370 aa37.03■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 ARMT1Q9H993 441 aa37.03■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa37.03■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXP2O15409 715 aa37.02■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 RASEFQ8IZ41 740 aa37.02■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 NLGN2Q8NFZ4 835 aa37.02■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L3A6NCW0 530 aa37.01■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L4A6NCW7 530 aa37.01■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L1Q7RTZ2 530 aa37.01■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 LCORLQ8N3X6 602 aa37.01■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 LARGE2Q8N3Y3 721 aa37.01■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 MIGA1Q8NAN2 632 aa37.01■■■■□ 3.52
CAPNS1-206ENST00000588815 ST18O60284 1047 aa37.01■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMA5P28066 241 aa37.01■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 IARSP41252 1262 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 NACAP1Q9BZK3 213 aa37.01■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa37■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 BAG3O95817 575 aa37■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 FGAP02671 866 aa37■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXW7Q969H0 707 aa37■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
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CAPNS1-206ENST00000588815 PPP4CP60510 307 aa36.99■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 GRIK5Q16478 980 aa36.99■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa36.99■■■■□ 3.51
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CAPNS1-206ENST00000588815 CYP21A2P08686 494 aa36.98■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
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CAPNS1-206ENST00000588815 GIMAP6Q6P9H5 292 aa36.97■■■■□ 3.51
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CAPNS1-206ENST00000588815 GSG1L2A8MUP6 293 aa36.96■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNL3Q8IZI9 196 aa36.96■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 CERS5Q8N5B7 392 aa36.96■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 MRIQ9BWK5 157 aa36.96■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO3BQ8WXR4 1341 aa36.96■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 NIM1KQ8IY84 436 aa36.95■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP36.95■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
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