RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565849.5

E2F4-206, Transcript of E2F transcription factor 4, human

TSL 3

Gene E2F4, Length 639 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
E2F4-206	ENST00000565849	CCDC102B	Q68D86	513 aa		33.33	■■■□□ 2.93
E2F4-206	ENST00000565849	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		33.33	■■■□□ 2.93
E2F4-206	ENST00000565849	NF2	P35240	595 aa		33.32	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		33.31	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	TEKT1	Q969V4	418 aa		33.31	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	XAGE2	Q96GT9	111 aa		33.31	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		33.31	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		33.3	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	ZIC5	Q96T25	663 aa		33.3	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		33.3	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	MAST3	O60307	1309 aa		33.29	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		33.29	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	NOG	Q13253	232 aa		33.29	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	PRKG1	Q13976	671 aa		33.29	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	SEMA3E	O15041	775 aa		33.28	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	CCDC102A	Q96A19	550 aa		33.28	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	COG6	Q9Y2V7	657 aa		33.28	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		33.28	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	CEP85	Q6P2H3	762 aa		33.27	■■■□□ 2.92
E2F4-206	ENST00000565849	SLC10A3	P09131	477 aa		33.26	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	RASGRF1	Q13972	1273 aa		33.26	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	RASA3	Q14644	834 aa		33.26	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	FZD1	Q9UP38	647 aa		33.26	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		33.26	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	PRDX5	P30044	214 aa		33.25	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		33.25	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		33.25	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		33.24	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		33.24	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	MRI	Q9BWK5	157 aa		33.24	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		33.24	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	TNFAIP1	Q13829	316 aa		33.23	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	GORAB	Q5T7V8	394 aa		33.23	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		33.23	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		33.23	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		33.23	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	ZBTB22	O15209	634 aa		33.22	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		33.22	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	CACNB3	P54284	484 aa		33.21	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	LBX1	P52954	281 aa		33.2	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		33.2	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		33.2	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
E2F4-206	ENST00000565849	TNNI3K	Q59H18	835 aa		33.19	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		33.19	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		33.19	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	TNNI2	P48788	182 aa		33.18	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		33.18	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		33.18	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	GPR108	Q9NPR9	543 aa		33.18	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		33.18	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	TSKS	Q9UJT2	592 aa		33.18	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	PI16	Q6UXB8	463 aa		33.17	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		33.17	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	ABCF2	Q9UG63	623 aa		33.17	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		33.16	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		33.16	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		33.16	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	SPATA5	Q8NB90	893 aa		33.15	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	TEPSIN	Q96N21	525 aa		33.15	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		33.15	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		33.15	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	PDE3A	Q14432	1141 aa		33.14	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		33.14	■■■□□ 2.9
E2F4-206	ENST00000565849	MAP3K11	Q16584	847 aa		33.13	■■■□□ 2.89
E2F4-206	ENST00000565849	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
E2F4-206	ENST00000565849	CA12	O43570	354 aa		33.12	■■■□□ 2.89
E2F4-206	ENST00000565849	MCAM	P43121	646 aa		33.12	■■■□□ 2.89
E2F4-206	ENST00000565849	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
E2F4-206	ENST00000565849	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
E2F4-206	ENST00000565849	CSRNP1	Q96S65	589 aa		33.12	■■■□□ 2.89
E2F4-206	ENST00000565849	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
E2F4-206	ENST00000565849	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		33.11	■■■□□ 2.89
E2F4-206	ENST00000565849	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		33.11	■■■□□ 2.89
E2F4-206	ENST00000565849	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		33.11	■■■□□ 2.89
E2F4-206	ENST00000565849	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		33.11	■■■□□ 2.89
E2F4-206	ENST00000565849	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89

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