RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 IFNL1Q8IU54 200 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 SOX10P56693 466 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 TEKT1Q969V4 418 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 AOX1Q06278 1338 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 BCAMP50895 628 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC5A1P13866 664 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 MRIQ9BWK5 157 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 MAST3O60307 1309 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 EYA2O00167 538 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF16BQ96L93 1317 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 LPIN2Q92539 896 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 HOOK2Q96ED9 719 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 ELP3Q9H9T3 547 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 CSADQ9Y600 493 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K9P80192 1104 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 OPTNQ96CV9 577 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 GRIK5Q16478 980 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 TEPSINQ96N21 525 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 FGFR2P21802 821 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO3Q9UK99 471 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 ERO1AQ96HE7 468 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM17Q9Y577 477 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 GJA5P36382 358 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 GTF2A2P52657 109 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM83AQ86UY5 434 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 SIL1Q9H173 461 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 CACNB3P54284 484 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 FKBP1CQ5VVH2 108 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 CIAO1O76071 339 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 CRHR2Q13324 411 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 VGLL4Q14135 290 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 DCAF15Q66K64 600 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 SP3Q02447 781 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF6Q15052 776 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP2B3Q16720 1220 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 CCER2I3L3R5 266 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 CCL15Q16663 113 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 OTUD5Q96G74 571 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPN18Q99952 460 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 WRNIP1Q96S55 665 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 ERO1BQ86YB8 467 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 EFCC1Q9HA90 598 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 SEMA3EO15041 775 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 GNAI3P08754 354 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 CETPP11597 493 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM151AQ8WW52 585 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
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