RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 H7C1D1 291 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 PPFIA2O75334 1257 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGEA8P43361 318 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 IQCF2Q8IXL9 164 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 DRC1Q96MC2 740 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 SETSIPP0DME0 302 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 SRGNP10124 158 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 GRM1Q13255 1194 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 GPC2Q8N158 579 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 EYA3Q99504 573 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 COL24A1Q17RW2 1714 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 PPIP5K2O43314 1243 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 C4orf46Q504U0 113 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 JADE2Q9NQC1 790 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPYL4Q9UJ04 414 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 EP400Q96L91 3159 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF123Q5XPI4 1314 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBED9Q6R2W3 1325 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 UBR3Q6ZT12 1888 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGB4P16144 1822 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 DDNO94850 711 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 CAMTA2O94983 1202 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 PANK2Q9BZ23 570 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 NFKBIEO00221 500 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 KINO60870 393 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 GSCP56915 257 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMD2Q13200 908 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 AGAP3Q96P47 875 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 BBOX1O75936 387 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA2012Q0VF49 1180 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC91Q7Z6B0 441 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 CNTROBQ8N137 903 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 IL17REQ8NFR9 667 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF2CQ99661 725 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 BABAM1Q9NWV8 329 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 ETAA1Q9NY74 926 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDH10Q9P2E7 1040 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 RAD50Q92878 1312 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF831Q5JPB2 1677 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 TAF1LQ8IZX4 1826 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 CBFA2T2O43439 604 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNA2P16389 499 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF394Q53GI3 561 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC24Q8N4L8 307 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 TRPC1P48995 793 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 ARL10Q8N8L6 244 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 MYL6BP14649 208 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 NFE2L2Q16236 605 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 CIAPIN1Q6FI81 312 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 MCM10Q7L590 875 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 RASSF4Q9H2L5 321 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 BCL2L12Q9HB09 334 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.37□□□□□ -1.552e-26■□□□□ 9.2
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAK2O60296 914 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX58O95786 925 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 XBP1P17861 261 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 NF2P35240 595 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 HSP90B2PQ58FF3 399 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 TATDN2Q93075 761 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 FAN1Q9Y2M0 1017 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-213ENST00000496055 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms