RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.18■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 UBE4AQ14139 1066 aa20.18■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.18■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 SPATA32Q96LK8 384 aa20.18■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 TAF1P21675 1872 aa20.17■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 LY75O60449 1722 aa20.17■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 KLHL34Q8N239 644 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 NAPBQ9H115 298 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 ARMT1Q9H993 441 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 GNAT2P19087 354 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 NLRP3Q96P20 1036 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-211ENST00000469733 RNF214Q8ND24 703 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 SBF2Q86WG5 1849 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 GYG1P46976 350 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 FOSBP53539 338 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 CFAP45Q9UL16 551 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 LCORLQ8N3X6 602 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 NEDD4P46934 1319 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 AFF2P51816 1311 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 B4E1Z4 1266 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 VPS37DQ86XT2 251 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 CHD4Q14839 1912 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 C4BP0C0L5 1744 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 CPLX1O14810 134 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 PPFIA3O75145 1194 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM87BQ96K49 555 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 ABCF2Q9UG63 623 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 C4AP0C0L4 1744 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 CYP7A1P22680 504 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 TDO2P48775 406 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 RAI14Q9P0K7 980 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 PRKAB2O43741 272 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 RFC4P35249 363 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 ATL3Q6DD88 541 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 LIG1P18858 919 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 GUCY1B3Q02153 619 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 KRT23Q9C075 422 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 SEMA3EO15041 775 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 C8orf76Q96K31 380 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-211ENST00000469733 NPHP1O15259 732 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms