RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, human

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	MRI	Q9BWK5	157 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	29.88	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	SRGAP3	O43295	1099 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	CAPN15	O75808	1086 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	RASA3	Q14644	834 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAP3K11	Q16584	847 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	RNF186	Q9NXI6	227 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	29.86	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	GNAI2	P04899	355 aa		29.84	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	TNFAIP1	Q13829	316 aa		29.84	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	29.84	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		29.84	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		29.84	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	FZD1	Q9UP38	647 aa		29.84	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		29.84	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	TRPA1	O75762	1119 aa		29.83	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	TEKT1	Q969V4	418 aa		29.83	■■■□□ 2.37
PPP1CB-208	ENST00000455580	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAST3	O60307	1309 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZBTB22	O15209	634 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	UNCX	A6NJT0	531 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	TM4SF4	P48230	202 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	TIMM10	P62072	90 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	PHKA1	P46020	1223 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	TEPSIN	Q96N21	525 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	SEMA3E	O15041	775 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	ADORA1	P30542	326 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	TNNI2	P48788	182 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	TFCP2	Q12800	502 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	SPRYD7	Q5W111	196 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	CCDC102B	Q68D86	513 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CB-208	ENST00000455580	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580		A0A1B0GUL7	405 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	ABHD8	Q96I13	439 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	CACNB3	P54284	484 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	XAGE2	Q96GT9	111 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	RLBP1	P12271	317 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	PRDX5	P30044	214 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	SREBF2	Q12772	1141 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	29.72	■■■□□ 2.35	1e-6	■□□□□ 11
PPP1CB-208	ENST00000455580	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	29.71	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	ATP8B2	P98198	1209 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	FAM83A	Q86UY5	434 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	WNK4	Q96J92	1243 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	29.71	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	POLA2	Q14181	598 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PPP1CB-208	ENST00000455580	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	INHBE	P58166	350 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	SSH3	Q8TE77	659 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	RASGRF1	Q13972	1273 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	TBC1D8	O95759	1140 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	DGKZ	Q13574	1117 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		29.66	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		29.66	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	GJA5	P36382	358 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAP3K9	P80192	1104 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	29.65	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	29.64	■■■□□ 2.34
PPP1CB-208	ENST00000455580	FAM151A	Q8WW52	585 aa		29.63	■■■□□ 2.33

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