RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A1B0GUL7 405 aa25.5■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 ADORA1P30542 326 aa25.5■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 PHKA1P46020 1223 aa25.5■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.5■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 MOB2Q70IA6 237 aa25.5■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 PANK1Q8TE04 598 aa25.5■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 SSH3Q8TE77 659 aa25.5■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 ZIC5Q96T25 663 aa25.5■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 VEZTQ9HBM0 779 aa25.5■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 SEMA3EO15041 775 aa25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 MS4A1P11836 297 aa25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC102BQ68D86 513 aa25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 TEKT1Q969V4 418 aa25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 MAST3O60307 1309 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC10A3P09131 477 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 XAGE2Q96GT9 111 aa25.47■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 TNFAIP1Q13829 316 aa25.46■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 RASA3Q14644 834 aa25.46■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.46■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.46■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.45■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 LBX1P52954 281 aa25.45■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.45■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.45■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.44■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.43■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 CA12O43570 354 aa25.43■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 PRKG1Q13976 671 aa25.43■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.43■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.43■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 PRDX5P30044 214 aa25.42■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 RASGRF1Q13972 1273 aa25.42■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP3K11Q16584 847 aa25.42■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 IFFO2Q5TF58 517 aa25.42■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 TNNI2P48788 182 aa25.41■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP85Q6P2H3 762 aa25.41■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR108Q9NPR9 543 aa25.41■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 FZD1Q9UP38 647 aa25.41■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.4■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 TEPSINQ96N21 525 aa25.4■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.39■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 CSRNP1Q96S65 589 aa25.39■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.39■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.39■■□□□ 1.66
UBE2E3-201ENST00000392415 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.38■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 GORABQ5T7V8 394 aa25.38■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 TNS4Q8IZW8 715 aa25.38■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.38■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 UNCXA6NJT0 531 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM83AQ86UY5 434 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 TSKSQ9UJT2 592 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 COG6Q9Y2V7 657 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 CACNB3P54284 484 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 TNNI3KQ59H18 835 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.36■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.36■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.36■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCF2Q9UG63 623 aa25.36■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA5Q8NB90 893 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 PDE3AQ14432 1141 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF186Q9NXI6 227 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3-201ENST00000392415 SPRYD7Q5W111 196 aa25.33■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
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