RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 STK32BQ9NY57 414 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 DEXIO95424 95 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 GCKRQ14397 625 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 MCM7P33993 719 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTPRE-201ENST00000254667 TACC1O75410 805 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTPRE-201ENST00000254667 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 SLC27A2O14975 620 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 PPP2R5BQ15173 497 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTPRE-201ENST00000254667 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRE-201ENST00000254667 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRE-201ENST00000254667 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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PTPRE-201ENST00000254667 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRE-201ENST00000254667 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRE-201ENST00000254667 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRE-201ENST00000254667 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRE-201ENST00000254667 PLCD4Q9BRC7 762 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRE-201ENST00000254667 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRE-201ENST00000254667 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.4■■□□□ 1.02
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