RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VSIRQ9H7M9 311 aa13.71□□□□□ -0.22
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FBP1P09467 338 aa13.66□□□□□ -0.22
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GNB2P62879 340 aa13.66□□□□□ -0.22
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C17orf58Q2M2W7 97 aa13.66□□□□□ -0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STUMQ69YW2 141 aa13.66□□□□□ -0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCN15Q6UWW0 184 aa13.66□□□□□ -0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF429Q86V71 674 aa13.66□□□□□ -0.22
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