RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565712.1

C15orf40-211, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene C15orf40, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-211ENST00000565712 CFHR3Q02985 330 aa11.53□□□□□ -0.56
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
C15orf40-211ENST00000565712 HOGA1Q86XE5 327 aa11.53□□□□□ -0.56
C15orf40-211ENST00000565712 SAMD12Q8N8I0 201 aa11.53□□□□□ -0.56
C15orf40-211ENST00000565712 BEST4Q8NFU0 473 aa11.53□□□□□ -0.56
C15orf40-211ENST00000565712 ADTRPQ96IZ2 230 aa11.53□□□□□ -0.56
C15orf40-211ENST00000565712 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
C15orf40-211ENST00000565712 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
C15orf40-211ENST00000565712 NUDT19A8MXV4 375 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 IGHG4P01861 327 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 HLA-DQB1P01920 261 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 LGALS7P47929 136 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 ARPC4P59998 168 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 PSG5Q15238 335 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 RTL8BQ17RB0 113 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 TMEM69Q5SWH9 247 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 C1QL4Q86Z23 238 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF645Q8N7E2 425 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 RNF152Q8N8N0 203 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 WFDC9Q8NEX5 89 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 C5orf30Q96GV9 206 aa11.52□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 TRAV41A0A0B4J266 112 aa11.51□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 G3V4G9 280 aa11.51□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 J3QRK9 145 aa11.51□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 RORCP51449 518 aa11.51□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 CX3CL1P78423 397 aa11.51□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 SAMD5Q5TGI4 173 aa11.51□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF695Q8IW36 515 aa11.51□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 GVQW1Q8N7I0 195 aa11.51□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.51□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 CMTM3Q96MX0 182 aa11.51□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 WSB1Q9Y6I7 421 aa11.51□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 NOTCH1P46531 2555 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 PLXNB1O43157 2135 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 G3V318 75 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 FCN1O00602 326 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 TUSC2O75896 110 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 GABARAPO95166 117 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 PTHLHP12272 177 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 PSMB8P28062 276 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 PPIFP30405 207 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 MYCNOSP40205 109 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 TMEM177Q53S58 311 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 GPR107Q5VW38 600 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 TMEM65Q6PI78 240 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF562Q6V9R5 426 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 C18orf65Q6ZTR6 163 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 C8orf86Q6ZUL3 223 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 GPR141Q7Z602 305 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 BVESQ8NE79 360 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 HARBI1Q96MB7 349 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 CLCC1Q96S66 551 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 IFT46Q9NQC8 304 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 NECAP2Q9NVZ3 263 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 COMMD3Q9UBI1 195 aa11.5□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 SHOXO15266 292 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 WIPF1O43516 503 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 SLC25A17O43808 307 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 CA2P00918 260 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 TAS2R20P59543 309 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 NDPQ00604 133 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 CTF1Q16619 201 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 ECSCRQ19T08 205 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 MINDY2Q8NBR6 621 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 DDB2Q92466 427 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 AP3S1Q92572 193 aa11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 MEIS3P1A6NDR6 274 aa11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 LINC00473A8K010 186 aa11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 IGLV1-40P01703 118 aa11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 IGLV2-23P01705 113 aa11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 APOA1P02647 267 aa11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 IGKV1-13P0DP09 117 aa11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 FCGR2CP31995 323 aa11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 ALDH3B2P48448 385 aa11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 MZT2AQ6P582 158 aa11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 ETV3LQ6ZN32 361 aa11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 LINC00482Q8N8I6 264 aa11.48□□□□□ -0.57
C15orf40-211ENST00000565712 OR5AP2Q8NGF4 316 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms