RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPS10P5Q9NQ39 176 aa13.76□□□□□ -0.21
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VHLLQ6RSH7 139 aa13.71□□□□□ -0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM180AQ6UWF9 173 aa13.71□□□□□ -0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HIST1H2BAQ96A08 127 aa13.71□□□□□ -0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
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