RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV3-15	P01624	115 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	PTAFR	P25105	342 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	SSTR5	P35346	364 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	G6PC	P35575	357 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	PLA2G5	P39877	138 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	OR2B8P	P59922	312 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	TLE4	Q04727	773 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	LCN15	Q6UWW0	184 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	HBZ	P02008	142 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A6	P12236	298 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	GLIPR1	P48060	266 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	RPRM	Q9NS64	109 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	GNG13	Q9P2W3	67 aa		11	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM210	A6NLX4	147 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	ZFP92	A6NM28	416 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF727	A8MUV8	499 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152		H3BQ15	152 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN1	O95832	211 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	MT-ND4L	P03901	98 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	WDR82	Q6UXN9	313 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	NINJ1	Q92982	152 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf30	Q96GV9	206 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	COQ2	Q96H96	371 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	NIT2	Q9NQR4	276 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PPE3	182 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	S100A6	P06703	90 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	EDDM3A	Q14507	147 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	ICAM4	Q14773	271 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	CEACAM1	P13688	526 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2K	P61086	200 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	COL10A1	Q03692	680 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	RHEB	Q15382	184 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	GUSBP1	Q15486	140 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	HES4	Q9HCC6	221 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.99	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GW64	132 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	BTBD17	A6NE02	478 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	OR5H1	A6NKK0	313 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	SELL	P14151	372 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	RAB5A	P20339	215 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	GCH1	P30793	250 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	SPINK9	Q5DT21	86 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF525	Q8N782	197 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	SARAF	Q96BY9	339 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	S1PR2	O95136	353 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	OR2C1	O95371	312 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV3-13	P01766	116 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV3-7	P01780	117 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	CD55	P08174	381 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	TLE1	Q04724	770 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF429	Q86V71	674 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	RAB39B	Q96DA2	213 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	OR4C12	Q96R67	309 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	TAAR6	Q96RI8	345 aa		10.98	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		10.97	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	OOEP	A6NGQ2	149 aa		10.97	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf98	A8MV24	154 aa		10.97	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	FOLR2	P14207	255 aa		10.97	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	COX5A	P20674	150 aa		10.97	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	PAX6	P26367	422 aa		10.97	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	RAB2A	P61019	212 aa		10.97	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	HBG1	P69891	147 aa		10.97	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	HBG2	P69892	147 aa		10.97	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	SSX7	Q7RTT5	188 aa		10.97	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	PIP4P1	Q86T03	277 aa		10.97	□□□□□ -0.65
BRF1-222	ENST00000635152	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		10.97	□□□□□ -0.65

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