RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUMA1Q14980 2115 aa0.79□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C9J4A7 227 aa0.79□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTNP21246 168 aa0.79□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAP1GDS1P52306 607 aa0.79□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VSNL1P62760 191 aa0.79□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF90Q03938 601 aa0.79□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BABAM2Q9NXR7 383 aa0.79□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RTTNQ86VV8 2226 aa0.79□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FABP7O15540 132 aa0.78□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDK14O94921 469 aa0.78□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 G6PCP35575 357 aa0.78□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP0.78□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SSX6Q7RTT6 188 aa0.78□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDRT4Q8N9R6 151 aa0.78□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR4P4Q8NGL7 312 aa0.78□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP0.78□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALG5Q9Y673 324 aa0.78□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF532Q9HCE3 1301 aa0.78□□□□□ -2.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM235A6NFC5 223 aa0.77□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRXO43186 299 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRHBPP24387 322 aa0.77□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACTR1BP42025 376 aa0.77□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL14P50914 215 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGF12P61328 243 aa0.77□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC35G5Q96KT7 338 aa0.77□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HINT2Q9BX68 163 aa0.77□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DLG5Q8TDM6 1919 aa0.77□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCB11O95342 1321 aa0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C2orf74A8MZ97 194 aa0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR10A3P58181 314 aa0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RELAQ04206 551 aa0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LHFPL5Q8TAF8 219 aa0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FNDC9Q8TBE3 224 aa0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGF13Q92913 245 aa0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRAP2Q96G30 205 aa0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DMAC2Q9NW81 257 aa0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAT2BQ9NZL9 334 aa0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNX24Q9Y343 169 aa0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM215AQ9Y5M1 114 aa0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ROS1P08922 2347 aa0.76□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00862A6NCI5 91 aa0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CSTAP01040 98 aa0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCL3P10147 92 aa0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPPCP23582 126 aa0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GADD45AP24522 165 aa0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDK2P24941 298 aa0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BSXQ3C1V8 233 aa0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CENPWQ5EE01 88 aa0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DOLPP1Q86YN1 238 aa0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDCL2Q8N4E4 241 aa0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CATSPER2Q96P56 530 aa0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MED18Q9BUE0 208 aa0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNX12Q9UMY4 172 aa0.75□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRIFINA4D1Z8 144 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GOLGA8IPA6NC78 632 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR5K4A6NMS3 321 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR171O14626 319 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF728P0DKX0 622 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATF1P18846 271 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OPRM1P35372 400 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSMB3P49720 205 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SULT1A2P50226 295 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERHP84090 104 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XIAPP98170 497 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASB17Q8WXJ9 295 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC39Q96DD0 335 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM216Q9P0N5 145 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR90Q96KV7 1748 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DSCAMO60469 2012 aa0.74□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1B0GW15 77 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZW10O43264 779 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1QCP02747 245 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ORM2P19652 201 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2KP61086 200 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSG3Q16557 428 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR10J3Q5JRS4 329 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AHSA2Q719I0 299 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM75Q8N9X5 138 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF133Q8WVZ7 376 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB1BQ9H0U4 201 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HHLA2Q9UM44 414 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANGPT4Q9Y264 503 aa0.73□□□□□ -2.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAV41A0A0B4J266 112 aa0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms