RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 GPR179Q6PRD1 2367 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 RNF222A6NCQ9 220 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 OR5H1A6NKK0 313 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 F5H0A9 414 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SH2D1BO14796 132 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 LYZL6O75951 148 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 PPYP01298 95 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 IGLV1-44P01699 117 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 WNT2P09544 360 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 KITLGP21583 273 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 CA6P23280 308 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 IL32P24001 234 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 DUSP1P28562 367 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 GCH1P30793 250 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 OPRM1P35372 400 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TIMP3P35625 211 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 NPBWR2P48146 333 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 BAMBIQ13145 260 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 OR8G1Q15617 311 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 OR2T2Q6IF00 324 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 RTN4RL2Q86UN3 420 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 COMMD7Q86VX2 200 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 GCNT2Q8N0V5 402 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 POC1AQ8NBT0 407 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 OR8G5Q8NG78 346 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 OR5T2Q8NGG2 359 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SLC25A40Q8TBP6 338 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 IL22RA2Q969J5 263 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TOMM40LQ969M1 308 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 KIRREL1Q96J84 757 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 CXXC4Q9H2H0 198 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM165Q9HC07 324 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 SLC2A9Q9NRM0 540 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM100Q9NV29 134 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 RASL12Q9NYN1 266 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 RDH8Q9NYR8 311 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 MBD2Q9UBB5 411 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 CSAG2Q9Y5P2 127 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-243ENST00000488923 DOCK10Q96BY6 2186 aa5.65□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 NCKAP5O14513 1909 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 E5RGE8 158 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 F8VVB4 439 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 F8VWA3 439 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 GPR31O00270 319 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 KLK10O43240 276 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 SYNGR1O43759 233 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 NXPH2O95156 264 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 SPDEFO95238 335 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 CDS2O95674 445 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 PDGFAP04085 211 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 NMBP08949 121 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 HOXB5P09067 269 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 PGA5P0DJD9 388 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF44P15621 663 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 PI3P19957 117 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 ERVK11-1P61568 191 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 HLA-DRB3P79483 266 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 IL15RAQ13261 267 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM187Q14656 261 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF146Q15072 292 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 TIMM23BQ5SRD1 257 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 C1orf185Q5T7R7 199 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 GPR157Q5UAW9 335 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 FAM180AQ6UWF9 173 aa5.64□□□□□ -1.51
HDLBP-243ENST00000488923 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
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