RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362957.1

RNU6-1290P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1290, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1290P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LDHAP00338 332 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RALAP11233 206 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PRKACAP17612 351 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IMPA1P29218 277 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GRPRP30550 384 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NAPAP54920 295 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NME5P56597 212 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DEFA6Q01524 100 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SCN1BQ07699 218 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 INCA1Q0VD86 236 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KCNJ8Q15842 424 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PDK4Q16654 411 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C1orf185Q5T7R7 199 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRAT1Q6PIZ9 186 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RASL11AQ6T310 242 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAM231DQ6ZW35 169 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KCTD9Q7L273 389 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CRLF3Q8IUI8 442 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C10orf67Q8IYJ2 551 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CLDN19Q8N6F1 224 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 Q8NFD4 153 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PROKR2Q8NFJ6 384 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR8B3Q8NGG8 313 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC7A13Q8TCU3 470 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF675Q8TD23 568 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 THRSPQ92748 146 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LRRC39Q96DD0 335 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CMBLQ96DG6 245 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 COQ2Q96H96 371 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FMO2Q99518 471 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SH3GL1Q99961 368 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM100Q9NV29 134 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WASHC3Q9Y3C0 194 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FHOD3Q2V2M9 1422 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ABCC4O15439 1325 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CEP192Q8TEP8 1941 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AKAP9Q99996 3911 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SBNO1A3KN83 1393 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A1W2PQD3 144 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IRGMA1A4Y4 181 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCDC160A6NGH7 325 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A8MXE2 369 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 J3KRW8 73 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 M0R3E3 92 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SDHDO14521 159 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FCMRO60667 390 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EEDO75530 441 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
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RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR4Q2P0C623 313 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MYL9P24844 172 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
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RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF846Q147U1 533 aa-1.45□□□□□ -2.64
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RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCDC186Q7Z3E2 898 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM150AQ86TG1 271 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LINC00596Q86U02 117 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC38A6Q8IZM9 456 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR1F12Q8NHA8 337 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WFDC5Q8TCV5 224 aa-1.45□□□□□ -2.64
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RNU6-1290P-201ENST00000362957 MITD1Q8WV92 249 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PSMF1Q92530 271 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NAT6Q93015 286 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NCLNQ969V3 563 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NRBF2Q96F24 287 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DTD2Q96FN9 168 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PPM1MQ96MI6 270 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SPRR2FQ96RM1 72 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TESK2Q96S53 571 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 VAT1Q99536 393 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CHID1Q9BWS9 393 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NDEL1Q9GZM8 345 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PPA2Q9H2U2 334 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM231Q9H6L2 316 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NIPAL2Q9H841 368 aa-1.45□□□□□ -2.64
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